More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24560 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24560  dienelactone hydrolase-like enzyme  100 
 
 
249 aa  492  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.278572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2276  Carboxymethylenebutenolidase  49.8 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0468  Carboxymethylenebutenolidase  36.84 
 
 
234 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0391  Carboxymethylenebutenolidase  34.01 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0190  carboxymethylenebutenolidase  33.06 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0203  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
230 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19899  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2831  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
230 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0276  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
230 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0258  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
230 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1266  carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
231 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0184  carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 
230 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.604168  hitchhiker  0.00492976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  31.02 
 
 
230 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4330  carboxymethylenebutenolidase  31.98 
 
 
232 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  30.58 
 
 
291 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  29.53 
 
 
251 aa  98.6  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9126  Carboxymethylenebutenolidase  35.48 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.970272  normal  0.684027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3645  carboxymethylenebutenolidase (dienelactone) hydrolase (DLH)  32.64 
 
 
236 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  28.74 
 
 
291 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1127  dienelactone hydrolase  32.23 
 
 
236 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2697  carboxymethylenebutenolidase  31.91 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5380  Carboxymethylenebutenolidase  33.49 
 
 
420 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  28.74 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7160  Carboxymethylenebutenolidase  31.94 
 
 
407 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115938  normal  0.549117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0274  carboxymethylenebutenolidase  32.41 
 
 
407 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  29.34 
 
 
232 aa  92  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0139  carboxymethylenebutenolidase  30.64 
 
 
232 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  31.06 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  29.1 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7175  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase)(DLH)  30.64 
 
 
410 aa  88.6  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  27.56 
 
 
247 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  27.05 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  27.05 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  27.05 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  26.69 
 
 
291 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2851  carboxymethylenebutenolidase  31.96 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0128923 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5412  Carboxymethylenebutenolidase  32.08 
 
 
233 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  28.35 
 
 
247 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3180  carboxymethylenebutenolidase  32.56 
 
 
433 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000051009  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5577  carboxymethylenebutenolidase  30.99 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7069  carboxymethylenebutenolidase  31.88 
 
 
408 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599928  normal  0.137084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  29.17 
 
 
275 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
223 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3160  carboxymethylenebutenolidase  32.24 
 
 
230 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.300765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  26.23 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1793  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 
411 aa  85.9  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.383832 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  27.05 
 
 
269 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5769  carboxymethylenebutenolidase  30 
 
 
295 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  26.23 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  26.23 
 
 
271 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  26.23 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2838  carboxymethylenebutenolidase  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0053  dienelactone hydrolase  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  32.55 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3138  dienelactone hydrolase family protein  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3915  dienelactone hydrolase family protein  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306599  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3834  dienelactone hydrolase family protein  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356995  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1705  dienelactone hydrolase family protein  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3413  dienelactone hydrolase family protein  31.84 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.934398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  29.39 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0381  carboxymethylenebutenolidase  29.63 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  25.82 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  30.45 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  25.82 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  25.82 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5021  carboxymethylenebutenolidase  32.8 
 
 
235 aa  82  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.0018188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  31.19 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  28.46 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2842  carboxymethylenebutenolidase  30.25 
 
 
232 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0520494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  32.57 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  29.53 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  27.76 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5771  carboxymethylenebutenolidase  32.92 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  26.25 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  26.95 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  30.53 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.86 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0283  carboxymethylenebutenolidase  30.91 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3956  hypothetical protein  32.98 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  27.76 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  28.16 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  26.16 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19040  Dienelactone hydrolase  31.54 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.896009  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  26.02 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2724  twin-arginine translocation pathway signal  32.51 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  25.69 
 
 
290 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29420  hypothetical protein  32.45 
 
 
413 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3288  carboxymethylenebutenolidase  28.28 
 
 
307 aa  78.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1285  carboxymethylenebutenolidase  27.27 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  27.57 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0207  twin-arginine translocation pathway signal  27.23 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  25.41 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  24.89 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>