45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12240 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12240  predicted ATP-grasp enzyme  100 
 
 		 424 aa  849    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.589336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06110  predicted ATP-grasp enzyme  48.36 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1888  protein of unknown function DUF201  48.64 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.205911  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12250  predicted ATP-grasp enzyme  45.48 
 
 		 419 aa  339  4e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16420  predicted ATP-grasp enzyme  45.41 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1730  ATP-grasp protein-like protein  45.75 
 
 		 418 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171571  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1887  ATP-grasp protein-like protein  43.24 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.615046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1390  putative ATP-grasp protein  39.95 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00627885  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  35.21 
 
 		 753 aa  242  7e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2122  ATP-grasp protein-like protein  31.84 
 
 		 428 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.598506  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1966  ATP-grasp protein  40.14 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151473  hitchhiker  0.0000495401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2532  hypothetical protein  30.64 
 
 		 408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0136  ATP-grasp protein  33.23 
 
 		 443 aa  184  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000567708  normal  0.0743555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0466  hypothetical protein  29.89 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1936  ATP-grasp protein-like protein  27.74 
 
 		 414 aa  153  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1663  putative ATP-grasp protein  22.84 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0312334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0630  hypothetical protein  25.86 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2168  ATP-grasp enzyme-like protein  25.58 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.862248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2881  ATP-grasp protein-like protein  25.09 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000202032  hitchhiker  0.00373255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0958  ATP-grasp enzyme-like  23.88 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1972  hypothetical protein  25.58 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0684  protein of unknown function DUF201  26.1 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2484  carbamoyl phosphate synthase-like protein  27.24 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.834927  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6484  ATP-grasp enzyme-like protein  24.92 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.810845  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0139  hypothetical protein  24.36 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6859  ATP-grasp enzyme-like protein  27.75 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1119  ATP-grasp enzyme-like protein  24.85 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1549  hypothetical protein  28 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2070  protein of unknown function DUF201  26.36 
 
 		 355 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6401  hypothetical protein  25.1 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0189  hypothetical protein  24.25 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0724  protein of unknown function DUF201  25.26 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0711  hypothetical protein  25.26 
 
 		 356 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1460  ATP-grasp enzyme-like protein  24.92 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0164  ATP-grasp enzyme-like  23.08 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2376  hypothetical protein  26.94 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0897  hypothetical protein  27.03 
 
 		 513 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.271555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4257  hypothetical protein  27.19 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2536  protein of unknown function DUF201  26.64 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.505707  normal  0.139385 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1884  ATP-grasp protein-like protein  24.44 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1744  alpha-L-glutamate ligase  28.45 
 
 		 331 aa  43.1  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1919  hypothetical protein  24.38 
 
 		 284 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.57396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2200  ribosomal protein S6 modification protein, putative  28.45 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0074  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.53 
 
 		 1075 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0073  carbamoyl phosphate synthase large subunit  27.53 
 
 		 1075 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>