More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10500 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10500  competence/damage-inducible protein CinA-like protein  100 
 
 		 172 aa  324  5e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.620562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2707  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 421 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  47.55 
 
 		 421 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  50.35 
 
 		 422 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  45.91 
 
 		 171 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2859  CinA domain protein  47.89 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  46.85 
 
 		 421 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  49.67 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  40 
 
 		 414 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  48.59 
 
 		 422 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  44.94 
 
 		 436 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2586  CinA-like  48.57 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.326299  hitchhiker  0.00472571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  50 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2886  CinA-like  46.48 
 
 		 211 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4307  CinA domain-containing protein  50.35 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4066  hypothetical protein  45.07 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1441  CinA protein  47.52 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.297767  normal  0.831105 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  46.51 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  39.74 
 
 		 411 aa  100  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  44.37 
 
 		 430 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  47.45 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1833  CinA-like  46.1 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.911534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  42.48 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3043  CinA domain protein  48.23 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  47.55 
 
 		 433 aa  99  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2816  CinA domain-containing protein  48.23 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  47.95 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  43.95 
 
 		 168 aa  97.8  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  42.38 
 
 		 203 aa  97.4  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2195  CinA protein  45.59 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000407296  hitchhiker  0.00000443632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3134  CinA domain-containing protein  43.17 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2574  CinA-like  43.66 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  46.67 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  47.89 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  48.03 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  38.16 
 
 		 408 aa  96.3  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  44.37 
 
 		 434 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  45.58 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2541  competence/damage-inducible protein CinA  41.33 
 
 		 423 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3921  CinA domain-containing protein  45.45 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  35.8 
 
 		 413 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  37.06 
 
 		 156 aa  95.1  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2233  CinA-like  48.2 
 
 		 140 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  41.14 
 
 		 371 aa  95.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1482  CinA domain-containing protein  45.14 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1438  CinA domain-containing protein  44.97 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.010805  hitchhiker  0.0000126181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  41.84 
 
 		 411 aa  94.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  44.37 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  48.65 
 
 		 203 aa  94.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  43.09 
 
 		 415 aa  94  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3003  CinA domain-containing protein  43.88 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.500427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  37.25 
 
 		 415 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4628  CinA domain protein  49.61 
 
 		 426 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1079  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 165 aa  93.6  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0607096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2833  putative competence-damaged inducible protein  44.14 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  49.65 
 
 		 438 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2934  CinA domain protein  45.52 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.476555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0571  CinA-like protein  42.14 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  42.41 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  47.18 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  43.06 
 
 		 382 aa  92.4  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1617  CinA domain protein  41.04 
 
 		 176 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.895217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1422  CinA domain-containing protein  43.05 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  44.83 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6535  CinA domain protein  42.76 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4476  CinA-like  40.13 
 
 		 168 aa  91.3  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  41.33 
 
 		 196 aa  90.9  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2431  CinA domain-containing protein  43.17 
 
 		 167 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.197767  normal  0.836165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1514  CinA domain-containing protein  40.38 
 
 		 167 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.381419 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0905  competence/damage-inducible domain-containing protein  36.05 
 
 		 364 aa  90.5  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.37369  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  42.65 
 
 		 413 aa  90.5  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  42.48 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  43.97 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 411 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  41.88 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  42.25 
 
 		 413 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  41.13 
 
 		 420 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  38.85 
 
 		 416 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  40 
 
 		 418 aa  88.6  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  44.52 
 
 		 218 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0265  competence/damage-inducible protein CinA  41.89 
 
 		 430 aa  89  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0226126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5926  CinA domain-containing protein  42.11 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  42.96 
 
 		 437 aa  89.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  36.73 
 
 		 362 aa  88.6  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1462  CinA domain-containing protein  44.52 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100792  normal  0.368331 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0175  CinA domain protein  42.48 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0883569 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  37.5 
 
 		 412 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  38.82 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1473  CinA domain protein  40.46 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2083  CinA domain-containing protein  40.82 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  45.59 
 
 		 408 aa  87.4  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  42.54 
 
 		 414 aa  86.7  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3376  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0987  putative competence-damage protein  37.76 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3175  competence damage-inducible protein A  39.73 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3241  competence damage-inducible protein A  40.74 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.450801  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  33.67 
 
 		 243 aa  87  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  37.67 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002518  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>