More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1183 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_1183  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.132915  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0049  recombinase  68.18 
 
 		 220 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00880033  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  61.81 
 
 		 203 aa  254  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0216  site-specific recombinase  53.2 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.613104 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0167  site-specific recombinase  47.8 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2438  Resolvase domain protein  45.08 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000895592 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5624  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  38.5 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  37.56 
 
 		 186 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  37.56 
 
 		 186 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  35.2 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2324  resolvase-like protein  55.17 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2322  DNA recombinase  50.49 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  38.29 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  38.29 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  34.18 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  34.69 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.87 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  34.87 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  34.87 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  34.87 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  34.87 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  39.75 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  33.5 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  35.38 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  39.76 
 
 		 191 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  34.34 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  34.69 
 
 		 188 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  36.02 
 
 		 235 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  34.87 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.79 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  34.85 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  34.27 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  39.79 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  39.06 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  34.33 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  35.05 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  32.29 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.09 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  31.28 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  35.6 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  34.83 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  36.84 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  31.44 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  34.33 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  32.7 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  35.11 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  34.21 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  30.26 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  32.77 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  31.66 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  29.47 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.5 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  29.32 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  29.41 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  29.41 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0096  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  32.99 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.77 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.31 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.77 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  29.95 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.32 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  31.28 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  35.48 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  27.89 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  29.17 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  29.17 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  29.17 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  30.26 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  33.54 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3655  Resolvase domain protein  28.92 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0554731  normal  0.301287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  29.74 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  30.61 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  31.43 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  30.69 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  27.46 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.93 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  34.62 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  27.51 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  34.39 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0155  resolvase x  32.12 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  36.57 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  32.16 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.5 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.5 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  26.04 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>