More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1324 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1324  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
645 aa  1290    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92156  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7663  histidine kinase  55.19 
 
 
639 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113237  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 
794 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0954175  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  46.67 
 
 
797 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  46.67 
 
 
797 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  46.67 
 
 
797 aa  197  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  46.67 
 
 
759 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  46.22 
 
 
797 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  46.22 
 
 
797 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  46.22 
 
 
797 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  46.22 
 
 
797 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1416  histidine kinase  45.18 
 
 
795 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
795 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458643  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0956  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
795 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00439356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
795 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.564395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4582  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
795 aa  193  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1318  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
795 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
828 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.3 
 
 
829 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0941  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
777 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0504124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
757 aa  155  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1006  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
777 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  40.61 
 
 
766 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1075  two-component system sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.38 
 
 
784 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  38.84 
 
 
751 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
754 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
776 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0006  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
513 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000267267  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4941  sensor histidine kinase  39.56 
 
 
799 aa  139  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4164  putative periplasmic CHASE2 sensor signal transduction histidine kinase  38.6 
 
 
819 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2626  diguanylate cyclase  31.16 
 
 
591 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0100044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4947  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
377 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0581  transmembrane sensor-like domain-containing protein  34.06 
 
 
828 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0428324  normal  0.0128662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2309  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.556346 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0500  sensor histidine kinase/response regulator  35.41 
 
 
364 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.823251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5512  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
785 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.830566  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3678  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
363 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4977  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2532  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 
854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2689  response regulator/sensor histidine kinase  34.93 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1396  response regulator/sensor histidine kinase  34.93 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3738  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524065  normal  0.172918 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1593  response regulator/sensor histidine kinase  34.93 
 
 
364 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2544  response regulator/sensor histidine kinase  34.93 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0252  response regulator/sensor histidine kinase  34.93 
 
 
365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.549911  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0216  sensor histidine kinase/response regulator  34.93 
 
 
364 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4578  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
377 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3785  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
377 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.76138  normal  0.119263 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0969  sensor histidine kinase/response regulator  34.45 
 
 
364 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5418  histidine kinase  32.17 
 
 
789 aa  115  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4653  histidine kinase  37.73 
 
 
799 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.688546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1010  histidine kinase  27.86 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
458 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.45 
 
 
561 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
457 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2801  diguanylate cyclase  27.57 
 
 
628 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.615763  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
590 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
445 aa  109  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0924  sensor histidine kinase; MrsK2 protein  27.36 
 
 
464 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
423 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  27.08 
 
 
560 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  33.63 
 
 
406 aa  107  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
590 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
476 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
449 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
920 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0907  sensor histidine kinase  27.04 
 
 
464 aa  106  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  30.67 
 
 
556 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3055  histidine kinase  28.97 
 
 
562 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  30.3 
 
 
729 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  32.9 
 
 
451 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
597 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
464 aa  105  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
883 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2797  histidine kinase  32.19 
 
 
583 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
737 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1056  diguanylate cyclase  27.68 
 
 
580 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.77678  normal  0.689214 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
350 aa  104  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  31.22 
 
 
398 aa  103  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
458 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  34.62 
 
 
387 aa  103  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
816 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.25 
 
 
587 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
502 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  27.97 
 
 
582 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  33.48 
 
 
363 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
563 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.25 
 
 
587 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
1029 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  32.63 
 
 
549 aa  101  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
430 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.000000024984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.8 
 
 
1093 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  32.33 
 
 
397 aa  101  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
373 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  29.37 
 
 
464 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0196  histidine kinase  33.33 
 
 
510 aa  101  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.447748  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
584 aa  101  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
817 aa  101  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>