52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0069 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0069  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4899  hypothetical protein  91.14 
 
 
162 aa  268  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.561738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5449  hypothetical protein  89.24 
 
 
162 aa  262  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.744205 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5622  hypothetical protein  98.41 
 
 
157 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0377786 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5237  hypothetical protein  98.41 
 
 
157 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4608  hypothetical protein  97.62 
 
 
157 aa  259  8e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2163  hitchhiker  0.0000946441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0238  protein of unknown function DUF1486  84 
 
 
157 aa  225  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5599  hypothetical protein  64.52 
 
 
151 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.0959248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1020  hypothetical protein  52.8 
 
 
158 aa  128  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5544  hypothetical protein  52.27 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.596432  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3628  hypothetical protein  52.8 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4739  hypothetical protein  52.8 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4378  hypothetical protein  48.41 
 
 
174 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.032150000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0282  pyruvate kinase  47.62 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0951  hypothetical protein  47.62 
 
 
174 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5482  hypothetical protein  45.6 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608961 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0353  putative pyruvate kinase  42.52 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2880  hypothetical protein  43.2 
 
 
129 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4731  protein of unknown function DUF1486  44.44 
 
 
155 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0708  hypothetical protein  42.74 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1476  hypothetical protein  39.34 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001568  possible membrane protein  36.59 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10133  hypothetical protein  39.02 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2881  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1397  protein of unknown function DUF1486  40.17 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2361  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6507  protein of unknown function DUF1486  32.59 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199296  normal  0.262757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4898  hypothetical protein  33.79 
 
 
253 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1495  protein of unknown function DUF1486  28.69 
 
 
255 aa  67.8  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.692441  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5094  hypothetical protein  34.92 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3038  hypothetical protein  31.58 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1955  hypothetical protein  30.97 
 
 
164 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.252213  hitchhiker  0.00353589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2434  hypothetical protein  32.31 
 
 
276 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355928  normal  0.0191811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1315  hypothetical protein  29.51 
 
 
254 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000687545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4311  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3606  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2199  hypothetical protein  30.6 
 
 
288 aa  58.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.944581  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4656  putative lipoprotein  31.58 
 
 
287 aa  57.4  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0150127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2666  protein of unknown function DUF1486  30.83 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0616  hypothetical protein  28.81 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.481239 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1288  hypothetical protein  30.72 
 
 
170 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3274  putative lipoprotein  31.3 
 
 
287 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.896395  normal  0.0865941 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5910  hypothetical protein  29.82 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2852  hypothetical protein  25.58 
 
 
254 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2299  hypothetical protein  30.95 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3812  putative lipoprotein  35.71 
 
 
280 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5064  hypothetical protein  28.07 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5527  protein of unknown function DUF1486  28.24 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.848344  hitchhiker  0.000266853 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4696  hypothetical protein  32.35 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0528913  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5221  hypothetical protein  27.7 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3928  protein of unknown function DUF1486  27.73 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2420  hypothetical protein  28.18 
 
 
222 aa  40.8  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>