More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3949 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3949  ABC Fe3+ transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
532 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305187  normal  0.0483056 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1836  ABC Fe+3 transporter, inner membrane subunit  69.64 
 
 
534 aa  611  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.374127  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.29 
 
 
534 aa  599  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.232577  normal  0.0312056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1591  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.69 
 
 
518 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.543872  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.29 
 
 
509 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.992663  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0606  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
536 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.19 
 
 
526 aa  352  8e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.80009  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.19 
 
 
526 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0924311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.19 
 
 
526 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
530 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
522 aa  340  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0398286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3782  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
526 aa  339  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.865045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.27 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.47 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.18 
 
 
521 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.25 
 
 
526 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43356  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
530 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.034918  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
536 aa  330  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.145655  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2838  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.54 
 
 
531 aa  329  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.16 
 
 
500 aa  326  7e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.03 
 
 
533 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.97601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
527 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2711  iron(III)-transport system permease  43.05 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0924971  normal  0.0430816 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1349  iron(III) ABC transporter, permease protein  43.05 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1462  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
528 aa  316  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.05 
 
 
503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0090372  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
527 aa  310  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62010  putative iron ABC transporter, permease protein  45.06 
 
 
512 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0428593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0530  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.34 
 
 
521 aa  309  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.46 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
525 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.905105  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6135  ABC transporter membrane spanning protein  40.79 
 
 
513 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8129  iron ABC transporter, permease protein  42.98 
 
 
502 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
536 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.609444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
530 aa  263  8.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.49 
 
 
515 aa  261  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000100634  normal  0.0519495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1174  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
528 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06270  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  40.91 
 
 
515 aa  250  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0952696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.57 
 
 
511 aa  237  4e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
511 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269197  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
543 aa  230  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
523 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
541 aa  221  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
514 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.923953  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
536 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.556719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.5168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
1057 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.442605 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
540 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
550 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.18 
 
 
550 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.714891  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 
545 aa  151  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0441  putative iron ABC transporter, permease protein  24.74 
 
 
533 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.388151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00163  putative ABC-type transport system, permease component  32.88 
 
 
507 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.452019  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
549 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
568 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0287363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0731  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.72 
 
 
567 aa  144  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0677887  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
561 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0894  ABC-type transport system, permease component  29.04 
 
 
553 aa  140  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000205423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
538 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
558 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5429  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.67 
 
 
555 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03434  hypothetical protein  26.91 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.867638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.07 
 
 
551 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3823  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.37 
 
 
569 aa  134  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0463  iron ABC transporter permease  32.69 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1510  ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0689  iron ABC transporter permease  32.69 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000577033  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1181  iron ABC transporter permease  32.69 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.881727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1377  iron ABC transporter permease  32.69 
 
 
570 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.300501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1381  iron ABC transporter permease  32.69 
 
 
570 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1778  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  31.9 
 
 
568 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.24 
 
 
562 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1198  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.79 
 
 
545 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4317  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.12 
 
 
562 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.946485  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002575  ferric iron ABC transporter permease protein  26.85 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.500484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47290  iron ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 
538 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.42 
 
 
559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3626  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 
562 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 
563 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0551  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
567 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.3 
 
 
554 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.104442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00284173  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 
550 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0163  putative iron(III) ABC transporter, fused inner membrane subunits  30.21 
 
 
557 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.17 
 
 
589 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0166577  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
570 aa  127  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.931275 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0782  iron-uptake permease inner membrane protein  27.62 
 
 
555 aa  127  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.297135  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0989  iron transport system permease protein  28.45 
 
 
529 aa  126  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
544 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0699  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  27.13 
 
 
589 aa  126  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
562 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00794358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>