More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3880 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  99.05 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  99.05 
 
 		 315 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  89.21 
 
 		 315 aa  577  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  92.7 
 
 		 315 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  92.06 
 
 		 315 aa  563  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  53.99 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  53.99 
 
 		 320 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 311 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  50.48 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 313 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  48.09 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 317 aa  287  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  46.35 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.87 
 
 		 318 aa  279  6e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  48.41 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 313 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 330 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 319 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  46.62 
 
 		 312 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  45.43 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  44.76 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  45.43 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 321 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 321 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  43.71 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  44.16 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  44.19 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 335 aa  234  1.0000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.07 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.07 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 324 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  45.13 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  42 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  39.5 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  38.75 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  41.1 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  38.63 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  42.46 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  39.41 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.41 
 
 		 344 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  43.52 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 345 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.09 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>