228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3093 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  99.66 
 
 		 295 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  99.32 
 
 		 295 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  94.58 
 
 		 293 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  87.12 
 
 		 293 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  87.8 
 
 		 293 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  83.73 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  72.89 
 
 		 287 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  77.46 
 
 		 312 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  77.11 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  76.76 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  76.76 
 
 		 287 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  76.76 
 
 		 287 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  76.76 
 
 		 287 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  76.76 
 
 		 287 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  58.82 
 
 		 299 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.75 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  57.54 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.79 
 
 		 287 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  52.96 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  55.52 
 
 		 287 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  55.16 
 
 		 287 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  50 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  51.4 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  51.4 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  51.75 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  56.34 
 
 		 288 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.14 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  33.56 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  36.11 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.31 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.17 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  35.59 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  31.65 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.06 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.63 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.57 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  34.36 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  35.59 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.78 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  32.12 
 
 		 306 aa  89.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.36 
 
 		 307 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.96 
 
 		 289 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.77 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  36.2 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  33.45 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  34.13 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  30.82 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  35.59 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.1 
 
 		 313 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  31.01 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  29.17 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  32.35 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  32.88 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.76 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  36.88 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  31.23 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  30.69 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.51 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  32.4 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  32.61 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  32.36 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.45 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  29.12 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.48 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.12 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  28.01 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  32.55 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  26.26 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  30.06 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.14 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.18 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.63 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  29.12 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  28.42 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  28.89 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 		 367 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  26.78 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  28.01 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>