More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5355 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5355  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4766  IclR family transcriptional regulator  99.21 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.556682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5506  IclR family transcriptional regulator  99.61 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0152  IclR family transcriptional regulator  88.45 
 
 		 255 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957112  normal  0.234996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1798  regulatory protein IclR  31.25 
 
 		 279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1566  IclR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.207708  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1527  regulatory proteins, IclR  34.96 
 
 		 257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1596  regulatory proteins, IclR  33.6 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.134859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1557  transcriptional regulator, putative  34.11 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149561  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5307  IclR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.144609  normal  0.0901346 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5401  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3258  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6484  regulatory protein, IclR  27.24 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476341  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  30.77 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1811  regulatory proteins, IclR  28.81 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3872  regulatory protein, IclR  28.87 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.207868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  23.81 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3866  IclR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4517  regulatory protein, IclR  27.92 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.530625  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.68 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.97 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0605  regulatory proteins, IclR  30.49 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2600  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.248836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5040  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 243 aa  72  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7585  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 567 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  25.96 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.62 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3621  regulatory protein, IclR  27.47 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.685113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  24.64 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.06 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  26.55 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  23.31 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1587  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236869  normal  0.497654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1189  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1669  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.307399  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0315  regulatory protein, IclR  29.41 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.24948  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2063  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2680  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0847  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1929  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3221  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00625745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  24.44 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3235  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4817  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1568  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1391  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3183  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1642  IclR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  24.5 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  22.08 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  23.35 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  27.75 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.25 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2569  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.459905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1216  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  25.89 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  22.94 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.27 
 
 		 260 aa  62  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  25.62 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  22.82 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  25.62 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1572  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0370671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0264  transcriptional regulator, IclR family  27.13 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  25.62 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  25.62 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  25.62 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  24.38 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.11 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0712  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  23.97 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  25.32 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  24.26 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0695  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  24.24 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  23.24 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0783  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0331  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>