More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6315 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6973  glycoside hydrolase family 3 protein  98.55 
 
 		 346 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6315  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 346 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.636822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1514  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 379 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1096  glycoside hydrolase family 3 protein  53.64 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6974  glycoside hydrolase family 3 protein  43.24 
 
 		 337 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6316  glycoside hydrolase family 3 protein  43.84 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.398008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1513  glycoside hydrolase family protein  43.31 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.72 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  33.21 
 
 		 511 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  37.87 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 		 594 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.34 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  37.08 
 
 		 604 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.36 
 
 		 520 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  33.2 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  37.4 
 
 		 656 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  34.01 
 
 		 538 aa  116  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  33.43 
 
 		 365 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  36.33 
 
 		 966 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.16 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.95 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  34.9 
 
 		 492 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  31.3 
 
 		 589 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  35.59 
 
 		 503 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.73 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 596 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 		 365 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  37.38 
 
 		 538 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.45 
 
 		 582 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  30.32 
 
 		 363 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.41 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.25 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 		 583 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.26 
 
 		 543 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  35.59 
 
 		 499 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  34.62 
 
 		 498 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.5 
 
 		 573 aa  107  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 484 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.76 
 
 		 534 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.76 
 
 		 534 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.51 
 
 		 482 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.05 
 
 		 552 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.97 
 
 		 591 aa  106  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.15 
 
 		 543 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  38.12 
 
 		 631 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0523  Beta-glucosidase-related glycosidase  28.47 
 
 		 403 aa  105  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.328579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  34.3 
 
 		 542 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.26 
 
 		 358 aa  104  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.27 
 
 		 992 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  31.64 
 
 		 520 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  37.08 
 
 		 575 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  29.85 
 
 		 517 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.26 
 
 		 698 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.04 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  33.96 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  28.37 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  35.09 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.44 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.09 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  29.35 
 
 		 544 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.82 
 
 		 528 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1845  beta-hexosaminidase  27.6 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0159028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  35.93 
 
 		 575 aa  99.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  31.41 
 
 		 585 aa  99.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.23 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.46 
 
 		 971 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 543 aa  99  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0154  glycoside hydrolase family 3 protein  25.51 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  30.86 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  31.65 
 
 		 990 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  31.2 
 
 		 481 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  32.09 
 
 		 592 aa  96.7  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  33.71 
 
 		 549 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  31.77 
 
 		 490 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 		 490 aa  95.9  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2109  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.47 
 
 		 353 aa  95.9  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.302973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.54 
 
 		 373 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.99 
 
 		 541 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2290  glycoside hydrolase family 3 protein  30.77 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  32.47 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2567  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.98 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.946372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.45 
 
 		 586 aa  93.6  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.89 
 
 		 426 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004407  beta N-acetyl-glucosaminidase  29.96 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4021  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 		 403 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0221723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  28.69 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0777  glycosy hydrolase family protein  26.52 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.696982  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  30.28 
 
 		 357 aa  92.8  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  26.24 
 
 		 586 aa  92  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  30.74 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.84 
 
 		 580 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00991  beta-hexosaminidase  31.2 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0575  beta-hexosaminidase  27.96 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  25.95 
 
 		 923 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.46 
 
 		 600 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2968  beta-hexosaminidase  33.93 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0265184  hitchhiker  0.0000639415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>