261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6057 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5693  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6057  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
196 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244111  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6542  flavodoxin/nitric oxide synthase  97.96 
 
 
196 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.381266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4063  hypothetical protein  83.51 
 
 
196 aa  317  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0979244  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4521  hypothetical protein  82.99 
 
 
196 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0923053  normal  0.429536 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5160  flavodoxin/nitric oxide synthase  71.58 
 
 
190 aa  280  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294272  normal  0.65126 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0456  flavodoxin/nitric oxide synthase  74.07 
 
 
211 aa  275  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3028  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.4 
 
 
184 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.305562  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1180  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.22 
 
 
183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3582  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.33 
 
 
184 aa  241  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3121  putative flavodoxin  64.94 
 
 
183 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1522  putative flavodoxin  61.54 
 
 
184 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2899  putative flavodoxin  62.98 
 
 
184 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478927  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2888  tryptophan repressor-binding protein  61.67 
 
 
184 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.386778  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4981  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.67 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3424  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.44 
 
 
184 aa  232  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.219787  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2573  putative flavodoxin  61.54 
 
 
184 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.620204  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2456  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.01 
 
 
184 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2929  putative flavodoxin  64.25 
 
 
193 aa  225  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4044  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.38 
 
 
204 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0041  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.44 
 
 
184 aa  221  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2551  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.01 
 
 
184 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0554  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.67 
 
 
184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.519186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22540  putative flavodoxin  56.59 
 
 
184 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135401  hitchhiker  0.0000186487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2874  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.26 
 
 
191 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00256934  hitchhiker  0.000000000000114365 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03044  tryptophan repressor binding protein  55.38 
 
 
191 aa  201  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0242  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.28 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449591  hitchhiker  0.00000000952931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0234  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.74 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0295  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.19 
 
 
190 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000113497 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2589  flavodoxin domain-containing protein  55.03 
 
 
191 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1966  flavodoxin domain-containing protein  55.03 
 
 
191 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.952042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0022  flavodoxin domain-containing protein  55.03 
 
 
264 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3792  tryptophan repressor binding protein  55.03 
 
 
191 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0417483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3854  tryptophan repressor binding protein  55.03 
 
 
191 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3520  flavodoxin domain-containing protein  55.03 
 
 
191 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3414  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.8 
 
 
190 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851071  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2791  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.19 
 
 
190 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0315  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.19 
 
 
190 aa  197  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3113  flavodoxin domain-containing protein  55.61 
 
 
237 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3127  flavodoxin domain-containing protein  54.5 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3529  multimeric flavodoxin WrbA  54.5 
 
 
191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2207  putative TRP repressor binding protein  54.74 
 
 
190 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.503271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2449  tryptophan repressor binding protein  51.34 
 
 
218 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2405  putative TRP repressor binding protein-like protein  53.19 
 
 
190 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.570978  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2011  flavodoxin/nitric oxide synthase  52.11 
 
 
190 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.61613  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3679  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.56 
 
 
190 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0287676  hitchhiker  0.00000000000590116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0278  flavoprotein  56.22 
 
 
190 aa  185  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000962932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4867  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.45 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392234  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1832  NADPH-dependent FMN reductase  47.37 
 
 
188 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.238885  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1090  NADPH-dependent FMN reductase  47.09 
 
 
213 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.665175  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4944  hypothetical protein  46.67 
 
 
203 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0236073  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0476  tryptophan repressor binding protein  47.51 
 
 
189 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0416  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.51 
 
 
189 aa  148  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.43833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0633  putative TRP repressor binding protein  45.31 
 
 
190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3284  NADPH-dependent FMN reductase  46.84 
 
 
192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1959  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 
189 aa  143  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4769  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.36 
 
 
201 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.217595 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1709  NADPH-dependent FMN reductase  46.15 
 
 
189 aa  140  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0120762  normal  0.0625376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1213  tryptophan repressor binding protein  46.91 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0487623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2749  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.15 
 
 
184 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1421  NADPH-dependent FMN reductase  39.69 
 
 
187 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.9217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1129  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.55 
 
 
205 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.92249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0487  multimeric flavodoxin  46.48 
 
 
159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1254  TRP repressor binding protein  37.29 
 
 
200 aa  118  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.128964  normal  0.538833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1570  NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
213 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.101574  hitchhiker  0.00239279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2684  tryptophan repressor binding protein  38.42 
 
 
195 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.501722  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2904  NADPH-dependent FMN reductase  38.76 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07059  oxidoreductase  44.2 
 
 
135 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001005  multimeric flavodoxin WrbA  43.57 
 
 
194 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3518  multimeric flavodoxin WrbA  33.51 
 
 
189 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1044  tryptophan repressor binding protein  38.64 
 
 
178 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  31.4 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  31.37 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  32.18 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  31.25 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0541  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0614  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0804749  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1333  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  31 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  28.5 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  31 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1261  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.33 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.46399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  30.85 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  29.95 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  30.35 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  28.36 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  26.6 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  28.16 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  27.86 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  29.21 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5291  TrpR binding protein WrbA  30.05 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  27.67 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1384  TrpR binding protein WrbA  29.7 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.106085  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  28.64 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  27.36 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  29.74 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1561  tryptophan repressor binding protein  37.61 
 
 
109 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.789174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1973  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.25 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425402  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  30.65 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  28.64 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>