More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1213 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  775    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27300  Na+/melibiose symporter-like transporter  48.98 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566046  normal  0.31967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4122  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6319  hypothetical protein  36.3 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.50707 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.34 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  29.06 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  29.06 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  29.06 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  29.06 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.93 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2448  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00172355  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  29.08 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30.37 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  29.65 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.31 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.31 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.68 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.35 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.55 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.06 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3648  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.78 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.09 
 
 		 1833 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.98 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  30.89 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.14 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.14 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.85 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.85 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.85 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.73 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.66 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  27.54 
 
 		 557 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.9 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2672  putative permease  21.55 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.929224  normal  0.0249328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>