236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0494 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0494  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 113 aa  228  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04310  transcriptional regulator, PadR family  62.73 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5391  transcriptional regulator, PadR family  61.26 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0917422  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5742  transcriptional regulator, PadR-like family  60 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4235  transcriptional regulator, PadR family  58.56 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324298  normal  0.0938031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2191  transcriptional regulator, PadR-like family  48.65 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  3.02647e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 109 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1103  transcriptional regulator, PadR-like family  50.46 
 
 		 118 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1533  transcriptional regulator, PadR-like family  47.75 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2527  PadR-like family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2537  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 115 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.33456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2473  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.140746  normal  0.551576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2621  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.065619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2817  hypothetical protein  47.22 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2812  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0612725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2819  hypothetical protein  45.95 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000193161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2570  PadR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 115 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1798  PadR family transcriptional regulator  50 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0304108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2613  PadR-like family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000539702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2859  hypothetical protein  46.3 
 
 		 115 aa  94  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000516824  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  48 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  48.96 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  47.47 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  38.1 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2348  PadR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0853  PadR family transcriptional regulator  34 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293414  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1497  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2026  PadR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000771993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3814  transcriptional regulator, PadR-like family  35.24 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375382  normal  0.563614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  38.27 
 
 		 116 aa  57  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0211  transcriptional regulator, PadR-like family  37.37 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.635433  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.55 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4256  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.102079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29180  predicted transcriptional regulator  37.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1070  transcriptional regulator, PadR-like family  35.11 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.188637  hitchhiker  0.000000498444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0195  PadR-like family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3483  hypothetical protein  30.3 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.134487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3711  hypothetical protein  30.3 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0645400000000003e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3757  hypothetical protein  30.3 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0360  transcriptional regulator, PadR-like family  33.75 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12940  predicted transcriptional regulator  35.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  30.39 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0346  PadR-like family transcriptional regulator  31 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1934  PadR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  37.89 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3730  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3380  PadR-like family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.114558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  28.71 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1513  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0927138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3802  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.991383  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0522  PadR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2935  transcriptional regulator, PadR-like family  31.37 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000047727  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4791  transcriptional regulator, PadR-like family  35.8 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  36.45 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0735  PadR-like family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3753  hypothetical protein  29.29 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.722643  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3448  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1244  transcriptional regulator, PadR-like family  38.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3399  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.314118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13523  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2816  transcriptional regulator, PadR-like family  32.11 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2744  transcriptional regulator, PadR-like family  33.67 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.167996  hitchhiker  0.000000256971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2347  PadR-like family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.68087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  32.73 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0175  transcriptional regulator, PadR-like family  31.03 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1858  PadR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000789415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1843  PadR-like family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0950  PadR-like family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000224962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  31.43 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3142  transcriptional regulator, PadR-like family  35.42 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0600315  hitchhiker  0.00163938 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  26.36 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_710  transcriptional regulator, PadR-type  32.89 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0242268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0617  PadR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0318  PadR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.490678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3780  transcriptional regulator, PadR family  36.11 
 
 		 108 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0742647  normal  0.491586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4530  PadR-like family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0884  transcriptional regulator, PadR-like family  38.75 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6512  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.299933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1891  PadR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240691  normal  0.0316492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2046  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3462  PadR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00016944  hitchhiker  0.00778578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>