269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6343 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6041  hypothetical protein  98.14 
 
 		 322 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607088 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6343  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4213  hypothetical protein  81.02 
 
 		 325 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6530  hypothetical protein  83.33 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6764  hypothetical protein  83.33 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0677125  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6352  hypothetical protein  82.67 
 
 		 303 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0096302  normal  0.506502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2348  protein of unknown function DUF72  72.95 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0606  hypothetical protein  62.72 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.785397  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4651  hypothetical protein  59.67 
 
 		 303 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1284  hypothetical protein  56.4 
 
 		 286 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.297288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3671  protein of unknown function DUF72  55.48 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5035  hypothetical protein  53.77 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2644  hypothetical protein  53.24 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0027235  normal  0.411348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3105  hypothetical protein  52.22 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578331 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2494  hypothetical protein  53.36 
 
 		 305 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3266  hypothetical protein  52.65 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4591  protein of unknown function DUF72  53.58 
 
 		 303 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3462  hypothetical protein  51.4 
 
 		 318 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36670  hypothetical protein  52.25 
 
 		 312 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0132299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3149  hypothetical protein  53.9 
 
 		 312 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4328  protein of unknown function DUF72  51.49 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2348  hypothetical protein  52.78 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.10184  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0960  hypothetical protein  51.86 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0086  protein of unknown function DUF72  51.37 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0034  hypothetical protein  48.25 
 
 		 340 aa  268  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  decreased coverage  0.00440217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2682  protein of unknown function DUF72  47.93 
 
 		 277 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34370  hypothetical protein  47.8 
 
 		 313 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1965  hypothetical protein  45.27 
 
 		 282 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00519894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3388  protein of unknown function DUF72  44.37 
 
 		 281 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0222  hypothetical protein  49.46 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0014  hypothetical protein  39.93 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.767606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4684  protein of unknown function DUF72  41.46 
 
 		 273 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0038  hypothetical protein  40.52 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0958  hypothetical protein  43.21 
 
 		 279 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0111418  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3609  hypothetical protein  41.28 
 
 		 272 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.945741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2157  hypothetical protein  41.64 
 
 		 265 aa  212  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0607  hypothetical protein  40.77 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23523 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4949  hypothetical protein  42.81 
 
 		 264 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.320638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1644  hypothetical protein  40.28 
 
 		 264 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4566  protein of unknown function DUF72  44.26 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1684  protein of unknown function DUF72  40.34 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.180097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1799  hypothetical protein  38.78 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00128055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4306  protein of unknown function DUF72  39.25 
 
 		 268 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5283  protein of unknown function DUF72  39.34 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2599  hypothetical protein  38.83 
 
 		 267 aa  202  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.209193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3659  hypothetical protein  37.84 
 
 		 267 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1234  hypothetical protein  37.24 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal  0.101491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4869  hypothetical protein  39.12 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1394  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  199  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159413  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0008  protein of unknown function DUF72  39.51 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5299  hypothetical protein  38.46 
 
 		 274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0219116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2196  hypothetical protein  39.1 
 
 		 267 aa  197  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4151  hypothetical protein  38.67 
 
 		 259 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2598  hypothetical protein  42.03 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0939  hypothetical protein  41.16 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1538  protein of unknown function DUF72  38.91 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0212  hypothetical protein  38.11 
 
 		 265 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2976  hypothetical protein  40.91 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.120346  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1739  protein of unknown function DUF72  37.93 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.964673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2198  hypothetical protein  39.16 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.389644  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1411  hypothetical protein  37.11 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1924  protein of unknown function DUF72  36.9 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2380  hypothetical protein  36.21 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0651  hypothetical protein  35.74 
 
 		 252 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0487  hypothetical protein  36.77 
 
 		 242 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1589  protein of unknown function DUF72  34.36 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2282  protein of unknown function DUF72  33.9 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  hitchhiker  0.0000430917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2656  hypothetical protein  33.9 
 
 		 245 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4267  hypothetical protein  33.69 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1898  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.945116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1232  protein of unknown function DUF72  37.6 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0835142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0127  hypothetical protein  34.25 
 
 		 246 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0831  hypothetical protein  32.88 
 
 		 249 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2641  protein of unknown function DUF72  34.15 
 
 		 241 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1898  protein of unknown function DUF72  32.75 
 
 		 244 aa  142  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0813  hypothetical protein  31.65 
 
 		 251 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.204786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0366  protein of unknown function DUF72  31.65 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.630598  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2325  protein of unknown function DUF72  31.96 
 
 		 244 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.018128  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0717  hypothetical protein  33.45 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4197  hypothetical protein  32.52 
 
 		 251 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.052496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6496  protein of unknown function DUF72  28.57 
 
 		 246 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.986106 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0783  hypothetical protein  33.45 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111895  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0831  protein of unknown function DUF72  33.1 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0835  protein of unknown function DUF72  32.43 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1212  protein of unknown function DUF72  30.72 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04829  DUF72  36.73 
 
 		 203 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0100  protein of unknown function DUF72  29.51 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3443  hypothetical protein  32.53 
 
 		 243 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2164  protein of unknown function DUF72  33.33 
 
 		 240 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15530  hypothetical protein  30.18 
 
 		 254 aa  119  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00151518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0222  protein of unknown function DUF72  27.18 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3035  hypothetical protein  32.4 
 
 		 246 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2778  hypothetical protein  31.49 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2822  hypothetical protein  31.49 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00815045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3234  protein of unknown function DUF72  33.1 
 
 		 244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2805  hypothetical protein  31.49 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3133  protein of unknown function DUF72  31.69 
 
 		 244 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3221  protein of unknown function DUF72  30.1 
 
 		 242 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06630  hypothetical protein  34.06 
 
 		 218 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>