More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5940 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  100 
 
 		 433 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  63.08 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  62.62 
 
 		 432 aa  477  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  54.35 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 438 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  54.12 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  43.1 
 
 		 429 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 444 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 		 448 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 434 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 428 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 428 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  39.48 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 474 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  35.48 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.58 
 
 		 448 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  123  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 410 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 446 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.94 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 429 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 426 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 440 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 436 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0346  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 450 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258915  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  22.2 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5191  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.83769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 436 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.85 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  26.08 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 439 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 430 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  25.45 
 
 		 454 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4663  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 455 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858594  normal  0.41723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.31 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  24.69 
 
 		 456 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.17 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  26.08 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.08 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.08 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>