286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5836 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6593  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  92.34 
 
 		 497 aa  877    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.783722  normal  0.178286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4838  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  76.06 
 
 		 549 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1825  histidine ammonia-lyase  76.06 
 
 		 549 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.26483 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5747  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  92.74 
 
 		 497 aa  882    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5104  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  75.71 
 
 		 534 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135455  normal  0.0115263 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5836  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 497 aa  975    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6111  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  92.74 
 
 		 497 aa  882    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5619  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  98.99 
 
 		 497 aa  967    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75216  normal  0.2633 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6911  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  61.73 
 
 		 495 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5918  phenylalanine/histidine ammonia-lyase  60.33 
 
 		 497 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18522 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2586  histidine ammonia-lyase  62.66 
 
 		 504 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206795  normal  0.158772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0506  histidine ammonia-lyase  59.54 
 
 		 495 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5274  histidine ammonia-lyase  53.28 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4832  histidine ammonia-lyase  53.83 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5827  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  53.78 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0365  histidine ammonia-lyase  52.7 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2648  histidine ammonia-lyase  52.66 
 
 		 500 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186623  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1260  histidine ammonia-lyase  52.7 
 
 		 523 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67260  putative histidine/phenylalanine ammonia-lyase  53.53 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0799  histidine ammonia-lyase  51.13 
 
 		 507 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.873754 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  39.06 
 
 		 507 aa  343  5e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  40.86 
 
 		 507 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  38.1 
 
 		 516 aa  317  3e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  42.52 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  38.84 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  43.19 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  41.41 
 
 		 526 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  42.25 
 
 		 520 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  39.29 
 
 		 511 aa  291  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  35.11 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  35.11 
 
 		 504 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  44.87 
 
 		 508 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  37.42 
 
 		 505 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  44.87 
 
 		 508 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  41.43 
 
 		 513 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  40.76 
 
 		 506 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  38.74 
 
 		 508 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  37.34 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  44.66 
 
 		 508 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0908  histidine ammonia-lyase  40.29 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  279  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  36.27 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  36.27 
 
 		 505 aa  279  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 506 aa  279  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 505 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  38.57 
 
 		 511 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  41.95 
 
 		 499 aa  276  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  40.64 
 
 		 514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  39.34 
 
 		 507 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  41.26 
 
 		 508 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  42.04 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  40.45 
 
 		 515 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  34.82 
 
 		 523 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  41.67 
 
 		 516 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  39.7 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  39.01 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  38.16 
 
 		 511 aa  269  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  37.45 
 
 		 511 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  36.86 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  38.36 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3837  histidine ammonia-lyase  39.47 
 
 		 536 aa  268  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.783362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  39.26 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1631  histidine ammonia-lyase  37.08 
 
 		 497 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.104747  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  38.98 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  38.77 
 
 		 513 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3001  histidine ammonia-lyase  40.82 
 
 		 534 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.463238  normal  0.112166 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39.46 
 
 		 507 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0324  histidine ammonia-lyase  36.38 
 
 		 497 aa  263  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  37.4 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  39.26 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3642  histidine ammonia-lyase  42.98 
 
 		 517 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.556064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  38.56 
 
 		 513 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  39.31 
 
 		 506 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  38.43 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3619  histidine ammonia-lyase  42.67 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2100  histidine ammonia-lyase  40.67 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0193312  normal  0.149962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  39.59 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  36.34 
 
 		 515 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 		 506 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1301  histidine ammonia-lyase  39.61 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  37.57 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4069  histidine ammonia-lyase  37.93 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.790613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  38.53 
 
 		 522 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  39.09 
 
 		 506 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  38.64 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  35.91 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  38.15 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  38.15 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67320  histidine ammonia-lyase  38.98 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6152  Histidine ammonia-lyase  41.48 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  38.15 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  37.18 
 
 		 510 aa  260  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>