More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5802 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
481 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  66.81 
 
 
479 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  93.96 
 
 
480 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  66.24 
 
 
482 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  68.29 
 
 
485 aa  646    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  65.9 
 
 
480 aa  634    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  67.79 
 
 
479 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  69.89 
 
 
477 aa  685    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  69.68 
 
 
479 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  79.17 
 
 
480 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  65.69 
 
 
479 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  67.65 
 
 
485 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
480 aa  977    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  66.11 
 
 
480 aa  631  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  65.47 
 
 
498 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  65.34 
 
 
479 aa  631  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  65.41 
 
 
480 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  64.42 
 
 
477 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  64.84 
 
 
477 aa  627  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  64.84 
 
 
477 aa  627  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  63.79 
 
 
478 aa  625  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  64.3 
 
 
482 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  64.63 
 
 
477 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  65.05 
 
 
477 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  65.97 
 
 
482 aa  621  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  64.41 
 
 
475 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  60.67 
 
 
478 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  62.45 
 
 
482 aa  590  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  64.97 
 
 
446 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  58.56 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  58.56 
 
 
480 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  56.63 
 
 
480 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
476 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  56.99 
 
 
483 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  55.39 
 
 
483 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  53.94 
 
 
491 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  54.58 
 
 
486 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  56.5 
 
 
478 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  54.37 
 
 
486 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  52.28 
 
 
486 aa  511  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  52.24 
 
 
487 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  54.66 
 
 
478 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
482 aa  495  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  66.86 
 
 
441 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
484 aa  481  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  52.03 
 
 
482 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  49.16 
 
 
482 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  46.74 
 
 
482 aa  416  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  44.07 
 
 
479 aa  396  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
503 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
498 aa  386  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
497 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  41.93 
 
 
493 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  41.09 
 
 
505 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  41.16 
 
 
500 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 
498 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
488 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.38 
 
 
483 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  43.28 
 
 
482 aa  368  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  42.71 
 
 
483 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  42.14 
 
 
498 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  44.37 
 
 
474 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  41.37 
 
 
496 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  38.46 
 
 
496 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  38.32 
 
 
499 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  38.41 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  40.17 
 
 
496 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  40.59 
 
 
493 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  42.17 
 
 
516 aa  354  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  40.84 
 
 
493 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
491 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3306  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 
497 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  39.79 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 
485 aa  343  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  38.56 
 
 
478 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  39.33 
 
 
485 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
481 aa  338  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 
480 aa  338  9e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0129  betaine aldehyde dehydrogenase  40.42 
 
 
494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00429668  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
490 aa  335  9e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
490 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1076  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
505 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.992962  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4047  Aldehyde Dehydrogenase  40.79 
 
 
468 aa  322  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6931  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.91 
 
 
479 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.80699  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3233  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.75 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.436611  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2177  betaine aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
496 aa  320  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2689  betaine aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3493  succinic semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
483 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.348419  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2635  betaine aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 
496 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  38.12 
 
 
493 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2084  aldehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
493 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2823  betaine aldehyde dehydrogenase  37.86 
 
 
491 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2257  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
493 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
493 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31700  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.88 
 
 
495 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465703  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
506 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2407  aldehyde dehydrogenase  37.71 
 
 
493 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.830868  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.08 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>