More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1648 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  33.72 
 
 
3093 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  98.95 
 
 
1530 aa  2907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  86.04 
 
 
1524 aa  2518    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  98.89 
 
 
1530 aa  2906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  32.26 
 
 
1582 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  100 
 
 
1528 aa  3064    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  31.23 
 
 
1653 aa  636    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  35.64 
 
 
1535 aa  629  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  34.1 
 
 
1486 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  33.21 
 
 
3090 aa  621  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  31.32 
 
 
3130 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 
4646 aa  602  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  32.82 
 
 
4647 aa  602  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  33.08 
 
 
3089 aa  600  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  38.59 
 
 
1424 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  38.56 
 
 
1909 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  41.83 
 
 
1911 aa  582  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  39.03 
 
 
1646 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  39.11 
 
 
1574 aa  573  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  32.43 
 
 
1497 aa  569  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  41.24 
 
 
2498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  34.73 
 
 
1795 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.57 
 
 
2454 aa  545  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  35.13 
 
 
1408 aa  543  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 
3108 aa  546  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  39.75 
 
 
1466 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  38.45 
 
 
2273 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  31.33 
 
 
2226 aa  536  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  38.8 
 
 
1489 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  37.78 
 
 
2679 aa  532  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  39.65 
 
 
1466 aa  532  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  40.14 
 
 
4265 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.23 
 
 
2604 aa  528  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  40.02 
 
 
4265 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  38.78 
 
 
1560 aa  529  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  32.67 
 
 
2093 aa  530  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  38.47 
 
 
4186 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.02 
 
 
4239 aa  526  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  38.29 
 
 
1470 aa  524  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.72 
 
 
3133 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  39.01 
 
 
1488 aa  523  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  37.85 
 
 
1520 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  40.72 
 
 
3127 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  38.45 
 
 
1302 aa  520  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  33.91 
 
 
1833 aa  516  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  36.64 
 
 
2150 aa  515  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  37.53 
 
 
2710 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  38.27 
 
 
1472 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  38.27 
 
 
1472 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  38.27 
 
 
1472 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  37.61 
 
 
2682 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
2551 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  37.81 
 
 
2684 aa  499  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 
1416 aa  496  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  33.37 
 
 
2316 aa  493  9.999999999999999e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.07 
 
 
3194 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 
995 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  38.49 
 
 
3335 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  34.15 
 
 
1612 aa  490  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  34.35 
 
 
2176 aa  491  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 
995 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  34.15 
 
 
1612 aa  490  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.75 
 
 
6889 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.1 
 
 
2762 aa  476  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.51 
 
 
2462 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 
974 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.52 
 
 
2551 aa  466  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  37.05 
 
 
3173 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 
1656 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 
2243 aa  460  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  32.53 
 
 
1087 aa  453  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  35.11 
 
 
3163 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.79 
 
 
4478 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
1874 aa  426  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  31.97 
 
 
1354 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  34.07 
 
 
1465 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  33.22 
 
 
1587 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 
2880 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  34.67 
 
 
3427 aa  420  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.33 
 
 
1349 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  34.71 
 
 
3275 aa  420  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  32.22 
 
 
1349 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.81 
 
 
1101 aa  416  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  32.51 
 
 
1337 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  35.68 
 
 
3424 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.34 
 
 
1372 aa  409  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2088  thiotemplate mechanism natural product synthetase  36.56 
 
 
2792 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.32 
 
 
950 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.73 
 
 
3176 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  35.12 
 
 
3337 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.56 
 
 
3099 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0138  TubD protein  46.84 
 
 
1353 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  33.19 
 
 
3252 aa  403  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1566  polyketide synthase, type I  46.84 
 
 
1329 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
1816 aa  403  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1647  polyketide synthase, type I  46.84 
 
 
1329 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
5400 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
5154 aa  400  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  35.32 
 
 
3696 aa  399  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 
3463 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>