65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0154 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  245  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  93.39 
 
 
561 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  93.39 
 
 
294 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  92.37 
 
 
578 aa  227  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  92.37 
 
 
586 aa  225  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  92.37 
 
 
584 aa  224  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  88.98 
 
 
585 aa  220  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  88.98 
 
 
568 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  88.14 
 
 
585 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  80.51 
 
 
586 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  80.51 
 
 
586 aa  204  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  78.81 
 
 
595 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  74.58 
 
 
584 aa  185  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  75.21 
 
 
584 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  73.5 
 
 
594 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  72.65 
 
 
593 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  66.95 
 
 
588 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  67.8 
 
 
590 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  66.95 
 
 
590 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.15 
 
 
581 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  49.53 
 
 
578 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  47.75 
 
 
564 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.95 
 
 
563 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  46.15 
 
 
572 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.99 
 
 
582 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.06 
 
 
574 aa  89.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  43.93 
 
 
563 aa  88.6  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  41.67 
 
 
592 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  40.17 
 
 
562 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.17 
 
 
562 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.32 
 
 
562 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  43.12 
 
 
580 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  38.46 
 
 
562 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.96 
 
 
570 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  38.46 
 
 
562 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  41.07 
 
 
585 aa  82  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.95 
 
 
568 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  43.27 
 
 
574 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  38.05 
 
 
581 aa  80.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  40.18 
 
 
556 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.17 
 
 
581 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.18 
 
 
587 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  39.47 
 
 
180 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  36.94 
 
 
570 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3780  hypothetical protein  63.16 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512618  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.12 
 
 
593 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  35.42 
 
 
566 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  37.74 
 
 
550 aa  63.5  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  32.63 
 
 
539 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.44 
 
 
591 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  33.04 
 
 
590 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  33.04 
 
 
590 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.44 
 
 
591 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.33 
 
 
591 aa  56.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.33 
 
 
592 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.14 
 
 
585 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.94 
 
 
560 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.68 
 
 
554 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.33 
 
 
566 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.98 
 
 
554 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  40.68 
 
 
570 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.07 
 
 
558 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.34 
 
 
557 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.36 
 
 
549 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  37.14 
 
 
582 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>