30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3780 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3780  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.512618  normal  0.350489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.07 
 
 		 586 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  64.29 
 
 		 561 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  63.16 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  64.29 
 
 		 578 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  64.29 
 
 		 584 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  62.5 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  62.5 
 
 		 568 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  62.5 
 
 		 585 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  62.5 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  60 
 
 		 584 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  59.65 
 
 		 586 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  59.65 
 
 		 586 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  62 
 
 		 595 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  84.85 
 
 		 584 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  60 
 
 		 2751 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  81.82 
 
 		 593 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  81.82 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  58 
 
 		 588 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  74.29 
 
 		 590 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  74.29 
 
 		 590 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  75.86 
 
 		 564 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  72.41 
 
 		 563 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.33 
 
 		 581 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  60.61 
 
 		 593 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  66.67 
 
 		 566 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  56.41 
 
 		 574 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  64.29 
 
 		 585 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  57.14 
 
 		 581 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  57.14 
 
 		 581 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>