62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2442 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2442  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0880  hypothetical protein  99.16 
 
 
237 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.480713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2578  SAM-dependent methyltransferases  98.73 
 
 
237 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0581  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3745  methyltransferase type 11  71.31 
 
 
236 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195128  normal  0.0952192 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5571  methyltransferase type 11  70.46 
 
 
236 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2248  hypothetical protein  70.89 
 
 
266 aa  315  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4897  methyltransferase type 11  70.21 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107852  hitchhiker  0.000103061 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3848  methyltransferase type 11  71.06 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391538  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3679  methyltransferase type 11  71.06 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321356  normal  0.0182124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4516  methyltransferase type 11  71.06 
 
 
235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178821  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1465  SAM-dependent methyltransferase  99.34 
 
 
152 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1662  hypothetical protein  99.34 
 
 
152 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516086  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2488  methyltransferase type 12  56.28 
 
 
238 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.363231  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4095  methyltransferase type 12  57.58 
 
 
244 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0229  hypothetical protein  33.88 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
228 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1013  Methyltransferase type 12  29.87 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.178018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3501  methyltransferase type 12  30.32 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2034  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
228 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0142527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1467  putative methyltransferase superfamily  28.51 
 
 
229 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000625282 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
224 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  35.87 
 
 
218 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4362  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
240 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3251  hypothetical protein  40.27 
 
 
224 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3708  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.434714  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38210  hypothetical protein  38.36 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000336854 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3121  methyltransferase type 12  36 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  36.68 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  36.77 
 
 
221 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  33.64 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  32.61 
 
 
221 aa  88.6  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  33.93 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3652  hypothetical protein  35.63 
 
 
243 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.282705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3787  hypothetical protein  31.95 
 
 
237 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206629  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0969  methyltransferase type 12  34.67 
 
 
232 aa  85.5  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.71453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  33.62 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.96 
 
 
231 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  29.77 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  28.1 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73140  hypothetical protein  32.73 
 
 
394 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  29.44 
 
 
312 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  30.83 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6348  hypothetical protein  31.82 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  25.5 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.43 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04751  methyltransferase  28.9 
 
 
407 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3364  hypothetical protein  31.2 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  32.98 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  26.14 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2608  hypothetical protein  24.79 
 
 
209 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0528964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2195  hypothetical protein  30.92 
 
 
400 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4563  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  42.86 
 
 
394 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0280  hypothetical protein  30.49 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.13  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
276 aa  42  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>