More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1208 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 494 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  68.65 
 
 		 494 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  88.19 
 
 		 570 aa  834    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  68.44 
 
 		 494 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  88.03 
 
 		 493 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 574 aa  1136    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  69.18 
 
 		 509 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  69.38 
 
 		 495 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 494 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  69.06 
 
 		 494 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  88.44 
 
 		 493 aa  808    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  62.12 
 
 		 489 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  61.46 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  61.01 
 
 		 490 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  57.72 
 
 		 485 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  57.52 
 
 		 485 aa  555  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 504 aa  553  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 504 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 473 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000129974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 477 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  46.95 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 498 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  50.83 
 
 		 488 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.69 
 
 		 488 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 488 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  39.24 
 
 		 508 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.0000000208159  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000722465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000615538  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.93 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 490 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  41.39 
 
 		 481 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4510  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 493 aa  286  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.670433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 496 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.46 
 
 		 472 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.99 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  40 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.95 
 
 		 475 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  36.7 
 
 		 520 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000152055  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5345  transcriptional regulator  40.78 
 
 		 506 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0493543 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 503 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.24 
 
 		 495 aa  277  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1143  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 496 aa  276  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  37.71 
 
 		 472 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  36.02 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.01 
 
 		 485 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 487 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 501 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41.2 
 
 		 492 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 467 aa  271  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.58 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.95 
 
 		 499 aa  270  7e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4020  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  34.63 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.703474  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 485 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 492 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  38.42 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  35.67 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 503 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 491 aa  267  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.2 
 
 		 495 aa  267  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3136  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.06 
 
 		 496 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 493 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.7 
 
 		 501 aa  266  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 523 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 502 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  39.71 
 
 		 487 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 506 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 509 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  39.64 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4721  GntR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 492 aa  264  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967408  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.76 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.53 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 506 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 486 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 506 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.34 
 
 		 514 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>