More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2270 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  100 
 
 
386 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6177  porin  71.58 
 
 
386 aa  525  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3838  porin  71.32 
 
 
386 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3684  porin  73.2 
 
 
386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4679  porin  73.2 
 
 
386 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2426  outer membrane protein (porin)  72.73 
 
 
386 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  61.52 
 
 
386 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  62.74 
 
 
386 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  61.52 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  61.26 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  61.26 
 
 
386 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  61.52 
 
 
386 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  60.62 
 
 
386 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  60.56 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  60.56 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  60.56 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  60.56 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  60.56 
 
 
411 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  60.56 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  60.56 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  61.92 
 
 
385 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  61.92 
 
 
385 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  61.1 
 
 
385 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  59.69 
 
 
393 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  60.5 
 
 
386 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  61.26 
 
 
385 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  58.2 
 
 
523 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  61.26 
 
 
385 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  60.99 
 
 
385 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  56.88 
 
 
394 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  55.56 
 
 
390 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  59.2 
 
 
393 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  57.81 
 
 
388 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4515  porin  55.76 
 
 
404 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.808645  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  55.73 
 
 
387 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  50.64 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  50.38 
 
 
390 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  50.9 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  50.13 
 
 
390 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  51.09 
 
 
390 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  50.38 
 
 
390 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  50.38 
 
 
390 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  50.65 
 
 
430 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  50.9 
 
 
390 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  51.33 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  50.9 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  51.33 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  50.9 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  50.9 
 
 
430 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  49.09 
 
 
376 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  49.09 
 
 
376 aa  329  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  48.83 
 
 
376 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6027  porin  48.19 
 
 
389 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  46.87 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.76 
 
 
389 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.09 
 
 
385 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  45.83 
 
 
385 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  43.48 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  43.48 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  43.48 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  43.48 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  43.48 
 
 
399 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  42.82 
 
 
383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  43.22 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  42.28 
 
 
391 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  41.22 
 
 
397 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  43.49 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  43.49 
 
 
383 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  41.48 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  41.48 
 
 
421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  44.01 
 
 
436 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  41.22 
 
 
397 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  42.03 
 
 
397 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  42.71 
 
 
383 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  41.98 
 
 
397 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  43.49 
 
 
436 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  43.49 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  43.49 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  43.49 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  43.49 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  43.49 
 
 
386 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  43.23 
 
 
386 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  42.59 
 
 
445 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  40.84 
 
 
389 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  40.71 
 
 
397 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  43.43 
 
 
378 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  43.35 
 
 
389 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.12 
 
 
389 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  43.93 
 
 
393 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  41.67 
 
 
402 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  41.42 
 
 
400 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  41.18 
 
 
400 aa  245  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  39.56 
 
 
393 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  44.48 
 
 
394 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  41.33 
 
 
395 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  43.68 
 
 
395 aa  238  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  43.68 
 
 
395 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4766  porin  37.94 
 
 
422 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.680804  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2171  porin Gram-negative type  40.41 
 
 
400 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  41.6 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>