More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0401 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 701 aa  1454    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  65.79 
 
 		 679 aa  929    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  51.86 
 
 		 607 aa  622  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  42.07 
 
 		 618 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  42.95 
 
 		 677 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  41.36 
 
 		 603 aa  467  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  41.15 
 
 		 682 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  43.5 
 
 		 606 aa  458  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 		 602 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 		 608 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 602 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  42.15 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  40.03 
 
 		 602 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  41.41 
 
 		 606 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 611 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  40.27 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 604 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 		 622 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  40.53 
 
 		 606 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 606 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.2 
 
 		 597 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 600 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.97 
 
 		 603 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 619 aa  422  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 		 605 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  38.23 
 
 		 600 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 599 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 616 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  40.22 
 
 		 599 aa  413  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 599 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 615 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 595 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 		 597 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 615 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.82 
 
 		 598 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 		 593 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 599 aa  399  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 601 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 607 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 		 602 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.43 
 
 		 606 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 601 aa  389  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 604 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 609 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000455356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  36.39 
 
 		 602 aa  379  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  38.62 
 
 		 612 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 597 aa  375  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 612 aa  363  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 596 aa  357  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 632 aa  347  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  0.0000276011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 622 aa  334  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 604 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 617 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 597 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 590 aa  310  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 605 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 610 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 612 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 606 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 602 aa  291  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 607 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  32.98 
 
 		 649 aa  289  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 597 aa  289  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 594 aa  289  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 605 aa  289  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0078  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0076  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0335816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 606 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 602 aa  283  6.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 606 aa  283  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 596 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 622 aa  282  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 633 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3973  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 630 aa  276  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 601 aa  276  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 612 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0075  AMP-binding family protein  32.79 
 
 		 568 aa  275  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 620 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0595  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3571  AMP-binding family protein  33.15 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 592 aa  274  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 602 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>