294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0325 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 
281 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  39.25 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 
225 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  37.7 
 
 
272 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  34.22 
 
 
226 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
232 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 
204 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  32.53 
 
 
210 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
226 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
226 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 
226 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
210 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  35.74 
 
 
208 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 
224 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
243 aa  95.9  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 
220 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 
210 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
226 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 
226 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
207 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  32.13 
 
 
215 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 
218 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 
223 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
207 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
198 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
223 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
221 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
204 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.28 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
220 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  29.07 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.33 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.48 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.02 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.02 
 
 
220 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  30.4 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.02 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.47 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.58 
 
 
427 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
205 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 
232 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1621  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
184 aa  64.7  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
224 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
214 aa  63.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
230 aa  63.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 
389 aa  62.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  27.01 
 
 
208 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.44 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
411 aa  62  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  23.62 
 
 
190 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  25.78 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.17 
 
 
213 aa  60.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.88 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 
212 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  22.91 
 
 
190 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
218 aa  59.3  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 
197 aa  59.3  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  23.48 
 
 
209 aa  59.3  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
225 aa  58.9  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
412 aa  58.9  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  27.27 
 
 
189 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.54 
 
 
206 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  28.52 
 
 
197 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 
208 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
195 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>