74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B4340 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4340  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
127 aa  264  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00199166  hitchhiker  0.00000000183641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1450  hypothetical protein  89.36 
 
 
70 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.193639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2212  RNA-directed DNA polymerase  32.81 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0905944  normal  0.180359 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0690  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.19 
 
 
429 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2250  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.19 
 
 
429 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461169  normal  0.551741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3822  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  34.19 
 
 
429 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.424359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2197  RNA-directed DNA polymerase  33.05 
 
 
458 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.187035  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.68 
 
 
439 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3886  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.92 
 
 
440 aa  53.9  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  31.36 
 
 
602 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4118  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.13 
 
 
440 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  30.97 
 
 
569 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4617  RNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 
585 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  32.74 
 
 
585 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4899  RNA-directed DNA polymerase  32.74 
 
 
585 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.539476  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.82 
 
 
502 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  35.24 
 
 
544 aa  47  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 
490 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.62 
 
 
507 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  29.51 
 
 
554 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  29.51 
 
 
634 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  27.87 
 
 
627 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2269  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  26.77 
 
 
446 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.295773  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  27.87 
 
 
627 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 
487 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  32.76 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  28.57 
 
 
434 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.70829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 
635 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  28.24 
 
 
635 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3486  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0901  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2517  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.111335  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2985  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3662  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0634868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4249  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0981  RNA-directed DNA polymerase  31.25 
 
 
490 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1129  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  24.81 
 
 
350 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.951259  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  25 
 
 
417 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3460  group II intron, maturase-specific domain-containing protein  31.25 
 
 
202 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.69 
 
 
415 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08258  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
504 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.867561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  34.18 
 
 
483 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01090  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
504 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02012  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
489 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02249  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
458 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02583  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
504 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06596  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
489 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06798  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
489 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 
571 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2471  group II intron, maturase  28 
 
 
434 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.546508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2146  reverse transcriptase  26.21 
 
 
134 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0955  group II intron, maturase  28 
 
 
434 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06460  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
311 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08274  RNA-directed DNA polymerase  30.21 
 
 
489 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 
565 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1825  RNA-directed DNA polymerase  30 
 
 
556 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2712  RNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 
490 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1438  RNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 
490 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2561  RNA-directed DNA polymerase  30.61 
 
 
490 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.181143  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  30.65 
 
 
490 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  29.75 
 
 
490 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 
413 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 
413 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 
413 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 
413 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  30.69 
 
 
413 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  32.67 
 
 
618 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2317  RNA-directed DNA polymerase  29.59 
 
 
490 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  24.79 
 
 
589 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  27.91 
 
 
568 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1733  reverse transcriptase  33.61 
 
 
492 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000121059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>