57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0364 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0364  phage repressor  100 
 
 
117 aa  243  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  34.23 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
497 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 
490 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4150  hypothetical protein  40.26 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2386  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0316  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2958  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.526804  normal  0.873082 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0309  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.793931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  38.89 
 
 
248 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  35.21 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0095  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
161 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0497  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00160476  normal  0.0662624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1500  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 
187 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  34.67 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1044  helix-turn-helix domain-containing protein  27.45 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0449357  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0504  transcriptional regulator  40.62 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1025  XRE family transcriptional regulator  27.45 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4934  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222644  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  33.82 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 
118 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  34.78 
 
 
133 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1163  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 
129 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  31.52 
 
 
229 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  43.86 
 
 
347 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  35.56 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1184  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 
73 aa  40.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410956  normal  0.167059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 
105 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  37.5 
 
 
196 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 
227 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.56 
 
 
107 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6198  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 
104 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  26.73 
 
 
277 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>