87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7490 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  59.6 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  50.94 
 
 		 105 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  51.72 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  42.86 
 
 		 107 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  45.12 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  47.37 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  43.53 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  42.35 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  40.24 
 
 		 264 aa  71.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  47.44 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  35.9 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  41.46 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.13 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  39.74 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  38.27 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  38.75 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  29.13 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  35.48 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  32.47 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  29.87 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 358 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  34.02 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  33.71 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  32.97 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  35.8 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  35.06 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.65 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  26.73 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  27.38 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  35.21 
 
 		 771 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  32.26 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  32.31 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  36.71 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  25.23 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  28.57 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  25 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  29.07 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0558  hypothetical protein  31.11 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  23.16 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.86 
 
 		 444 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  28.26 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  35.06 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  29.35 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 		 318 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  29.17 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  28.74 
 
 		 336 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  25.93 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  30.43 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29.35 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  28.12 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  28.05 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.07 
 
 		 749 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  28.26 
 
 		 116 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  29.17 
 
 		 116 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  30.43 
 
 		 125 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  26.83 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  26.67 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.21 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  29.21 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.21 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.21 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 623 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  26.83 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  31.08 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  29.73 
 
 		 539 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>