261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4728 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4728  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  939    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1038  patatin  40.82 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1045  Patatin  39.87 
 
 		 346 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.150468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1734  patatin  35.51 
 
 		 355 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.761645  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0810  Patatin  33.44 
 
 		 347 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163365 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2026  patatin  36.36 
 
 		 362 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.456959  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4690  putative esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily, Patatin-like phospholipase domain-containing protein  37.27 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000250129  normal  0.2345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0732  patatin  35.67 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.804984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0726  hypothetical protein  30.82 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0706  hypothetical protein  30.82 
 
 		 341 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1858  patatin  35.13 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000552891  normal  0.630364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0829  patatin  36 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0136404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1202  patatin  35.51 
 
 		 375 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  35.96 
 
 		 346 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1614  patatin  38.13 
 
 		 347 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16840  FabD/lysophospholipase-like protein  35.28 
 
 		 340 aa  179  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0025923  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  34.71 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5355  Patatin  34.08 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0078  alpha/beta fold family hydrolase  38.12 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5552  patatin  33.64 
 
 		 343 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  34.7 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5048  patatin  34.97 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837426 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0792  patatin  37.82 
 
 		 347 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3463  hypothetical protein  35.33 
 
 		 358 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.702595  normal  0.0993418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4482  patatin  34.45 
 
 		 357 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1769  patatin  35.44 
 
 		 360 aa  172  7.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0779  patatin  34.35 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0392351 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  33.54 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1598  patatin  34.29 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  33.23 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0703  patatin  33.91 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0742  Patatin  34.35 
 
 		 346 aa  171  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.165524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3008  patatin  31.11 
 
 		 354 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1879  Patatin  33.97 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.817162  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0908  patatin  33.33 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1495  patatin  32.81 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1051  patatin  34.23 
 
 		 345 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0557  patatin  33.33 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0550  Patatin  35.89 
 
 		 348 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  37.77 
 
 		 352 aa  163  8.000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3930  patatin  33.54 
 
 		 375 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2551  hypothetical protein  32.6 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.712482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3052  patatin  32.74 
 
 		 394 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.896027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3639  patatin  29.97 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1641  Patatin  33.44 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07230  FabD/lysophospholipase  34.46 
 
 		 315 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2313  patatin  31.63 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.150597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3621  patatin  30.18 
 
 		 444 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1341  patatin  31.78 
 
 		 342 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1814  patatin  34.44 
 
 		 351 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0348448  normal  0.0254439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1543  hypothetical protein  30.96 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0910805  normal  0.119184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2137  patatin  37.8 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2491  patatin  36.96 
 
 		 346 aa  127  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5464  Patatin  34.44 
 
 		 370 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4953  Patatin  31.99 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0856  Patatin  30.65 
 
 		 321 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1824  Patatin  30.03 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3988  Patatin  30.86 
 
 		 354 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1906  patatin  28.47 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4448  Patatin  29.15 
 
 		 365 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1390  patatin  32.14 
 
 		 330 aa  89.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.986013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2310  Patatin  28.62 
 
 		 371 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  33.65 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  31.98 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  31.98 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  31.15 
 
 		 379 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  31.98 
 
 		 405 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0022  patatin family phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1523  patatin-like phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1446  patatin-like phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.369795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0020  patatin family phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  31.67 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0020  patatin family phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1166  patatin family phospholipase  30.83 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0016  patatin-like phospholipase  30.83 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  32.02 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  31.64 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  31.98 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  31.98 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0018  patatin-like phospholipase  30.49 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2818  Patatin  25.35 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.119451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  30.42 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1783  Patatin  29.41 
 
 		 321 aa  83.2  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  32.2 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3168  patatin  30.52 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  32.29 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  31.93 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  33.08 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  30.42 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  31.74 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  29.02 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  32.13 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  28.23 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4591  patatin  33.91 
 
 		 365 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.146284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  28.16 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.17 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.1 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  29.49 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>