52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4599 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  100 
 
 		 86 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  75.32 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  60 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  63.16 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  53.85 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  53.57 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  67.5 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  67.5 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  43.84 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  43.84 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  60.98 
 
 		 72 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  49.06 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1916  SpoVT/AbrB-like protein  54.9 
 
 		 55 aa  52.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  42.65 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  47.14 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  45.45 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.16 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  48.57 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  66.67 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.83 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.06 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  58.97 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  38.96 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  53.45 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.67 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.26 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  38.96 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  40.7 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  35.44 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  45.45 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  36.99 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  50 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  52.63 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  35.94 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  36.92 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  48.78 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  38.64 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  60.61 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  43.9 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  38.6 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  43.9 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  41.79 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  32.35 
 
 		 79 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  34.72 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  32.35 
 
 		 79 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.39 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  33.8 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.46 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.46 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  40.79 
 
 		 100 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>