75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1217 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  653    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.79 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  33.01 
 
 		 275 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  31.6 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  27.45 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  29.86 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  29.76 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  27.81 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  28.96 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  28.19 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.23 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  27.48 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  26.21 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  25.53 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  26.82 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  25.65 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  24.89 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  26.58 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  26.01 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  29.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  27.08 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 267 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.83 
 
 		 594 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0088  phospholipase/Carboxylesterase  31.01 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  24.64 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  31.68 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.78 
 
 		 626 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0257  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.01 
 
 		 692 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173307  normal  0.117372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.7 
 
 		 607 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4204  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.66 
 
 		 688 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.25 
 
 		 683 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.35 
 
 		 682 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.98 
 
 		 626 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  24.65 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 		 682 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  30.73 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.98 
 
 		 626 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  25 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  24.64 
 
 		 246 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.39 
 
 		 642 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.35 
 
 		 682 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  28.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  28.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3328  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  28.07 
 
 		 680 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  28.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.11 
 
 		 692 aa  45.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0280  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.27 
 
 		 691 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0218875  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  29.93 
 
 		 651 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  28.45 
 
 		 612 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  23.59 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  28 
 
 		 369 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3949  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.31 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.994388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  24.23 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  27.74 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  26.24 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  29.29 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3714  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.55 
 
 		 650 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  24.78 
 
 		 661 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  25.38 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0048  prolyl oligopeptidase family protein  29.32 
 
 		 642 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.436282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.59 
 
 		 607 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  26.02 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.18 
 
 		 642 aa  42.7  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.56 
 
 		 630 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.42 
 
 		 644 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.42 
 
 		 644 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  23 
 
 		 248 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>