More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0687 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 436 aa  860    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  76.47 
 
 		 428 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  74.58 
 
 		 434 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  74.82 
 
 		 428 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  42.01 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  42.48 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.3 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  40.97 
 
 		 431 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  40.37 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 444 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 440 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  34.56 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.66 
 
 		 453 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  27.84 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.23 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  25.8 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.71 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  26.82 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 419 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  24.29 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.27 
 
 		 436 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.44 
 
 		 449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  26.05 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.16 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  25.87 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  24.56 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4735  galactarate transporter  25.85 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388057  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.81 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.81 
 
 		 454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  24 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 436 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 410 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  26.7 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  24.44 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  24.37 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  23.65 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  23.65 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  23.65 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.18 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 436 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.24 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.24 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.24 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.75 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.75 
 
 		 454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.24 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 430 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  24.4 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  24.4 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>