More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0938 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  62.36 
 
 
559 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  62.36 
 
 
559 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  59.93 
 
 
558 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  62.55 
 
 
554 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  100 
 
 
555 aa  1115    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  60.11 
 
 
557 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  59.19 
 
 
557 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  59.38 
 
 
557 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  59.04 
 
 
557 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  55.48 
 
 
561 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  56.52 
 
 
557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  55.08 
 
 
557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  54.76 
 
 
561 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  55.2 
 
 
562 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  56.01 
 
 
561 aa  566  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  55.3 
 
 
561 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  52.49 
 
 
565 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  55.12 
 
 
561 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  51.75 
 
 
557 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  51.45 
 
 
553 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  54.53 
 
 
557 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  52.31 
 
 
554 aa  534  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  52.17 
 
 
566 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  52.17 
 
 
566 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  52.08 
 
 
565 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  48.46 
 
 
557 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  46.67 
 
 
553 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  44.8 
 
 
554 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  42.73 
 
 
577 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  42.39 
 
 
549 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  43.29 
 
 
565 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  43.16 
 
 
570 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  42.49 
 
 
546 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  42.49 
 
 
546 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  41.16 
 
 
549 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  43.48 
 
 
547 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  43.04 
 
 
546 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  41.99 
 
 
553 aa  348  1e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  40.93 
 
 
564 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.12 
 
 
559 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  42.58 
 
 
556 aa  326  7e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.32 
 
 
560 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  35.54 
 
 
554 aa  319  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.93 
 
 
552 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 
559 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  33.57 
 
 
552 aa  312  9e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  36.69 
 
 
552 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  33.99 
 
 
555 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  32.86 
 
 
552 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  32.86 
 
 
552 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  307  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  32.86 
 
 
552 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  32.86 
 
 
552 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  33.51 
 
 
552 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  33.87 
 
 
553 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.43 
 
 
553 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.81 
 
 
552 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.81 
 
 
552 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.43 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  34.06 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.81 
 
 
552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.28 
 
 
557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  32.25 
 
 
553 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 
556 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 
589 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.43 
 
 
553 aa  303  5.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 
557 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.01 
 
 
553 aa  302  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.39 
 
 
554 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.8 
 
 
608 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.8 
 
 
556 aa  302  1e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 
558 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  33.69 
 
 
555 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.04 
 
 
557 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  32.73 
 
 
555 aa  299  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 
576 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  32.5 
 
 
553 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  34.83 
 
 
555 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  32.92 
 
 
553 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.92 
 
 
558 aa  297  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33.27 
 
 
556 aa  298  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  31.61 
 
 
553 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  34.1 
 
 
553 aa  297  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  31.61 
 
 
553 aa  297  4e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 
549 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  31.61 
 
 
553 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
549 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 
549 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  35.38 
 
 
549 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  33.87 
 
 
591 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  31.5 
 
 
565 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>