215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38590 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38590  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0400  Alpha/beta hydrolase  54.67 
 
 
203 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3114  alpha/beta hydrolase fold  55.33 
 
 
203 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5253  alpha/beta hydrolase fold  55.33 
 
 
203 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5020  alpha/beta hydrolase  54.67 
 
 
203 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.737284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0348  Alpha/beta hydrolase fold-1  49.66 
 
 
205 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0367  alpha/beta hydrolase fold  48.99 
 
 
207 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3518  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 
200 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0376  alpha/beta hydrolase fold protein  48.63 
 
 
207 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.338833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.57 
 
 
268 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  46.03 
 
 
298 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 
285 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
339 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  48.08 
 
 
308 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  48.98 
 
 
288 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5645  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
273 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530376  normal  0.570131 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
246 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
275 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.78 
 
 
295 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
288 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.32 
 
 
425 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
289 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
315 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
309 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  30.53 
 
 
285 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
256 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
296 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  30.53 
 
 
285 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
234 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 
277 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5341  alpha/beta hydrolase  26.06 
 
 
251 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383955  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3423  thioesterase  26.06 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  40.35 
 
 
284 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4945  thioesterase  26.06 
 
 
251 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
363 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  21.67 
 
 
345 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
274 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.12 
 
 
251 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3458  hydrolase protein  40 
 
 
306 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326966  hitchhiker  0.00447624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 
254 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
289 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  46.94 
 
 
288 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 
258 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
280 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
281 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.464131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  46 
 
 
284 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
272 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
307 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
284 aa  47  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  28.66 
 
 
257 aa  47.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
268 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
284 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
287 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3587  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
296 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
288 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  23.5 
 
 
255 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 
279 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  24.86 
 
 
284 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.04 
 
 
285 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
289 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
298 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0513  Alpha/beta hydrolase  47.73 
 
 
229 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000581936  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
300 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.838844  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  23.39 
 
 
279 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0077  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  22.89 
 
 
252 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.44 
 
 
298 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  48.98 
 
 
271 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  48.98 
 
 
271 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
261 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
279 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  34.29 
 
 
272 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  30.37 
 
 
294 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1674  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
302 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0685799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
239 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4297  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
259 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32686  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  43.75 
 
 
297 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  25.77 
 
 
322 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  40 
 
 
289 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6262  alpha/beta hydrolase  26.19 
 
 
230 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  24.46 
 
 
263 aa  44.7  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  40.54 
 
 
288 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.63 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.39 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
261 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
234 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  24.86 
 
 
305 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.5 
 
 
288 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.63 
 
 
293 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.35 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.21 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.21 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.63 
 
 
288 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  26.63 
 
 
293 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.21 
 
 
279 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  33.53 
 
 
387 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.63 
 
 
293 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>