More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30990 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30990  Transcriptional regulator LysR family protein  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2930  LysR family transcriptional regulator  64.72 
 
 		 309 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2072  LysR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 308 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1510  LysR family transcriptional regulator  60.86 
 
 		 312 aa  361  9e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451093  normal  0.28121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5034  transcriptional regulator, LysR family  59.34 
 
 		 308 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3487  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  58.5 
 
 		 307 aa  354  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02290  LysR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.107615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0261  putative transcriptional regulator  56.39 
 
 		 310 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3875  putative transcriptional regulator  57.52 
 
 		 307 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656109  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5381  LysR family transcriptional regulator  56.91 
 
 		 307 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.5816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4436  LysR family transcriptional regulator  54.15 
 
 		 305 aa  318  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1853  LysR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0383468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1754  LysR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3859  LysR family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1429  LysR family transcriptional regulator  51.32 
 
 		 312 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1464  LysR family transcriptional regulator  51.64 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0526  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0720  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0634  transcription regulator protein  38.44 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0600  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000458  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6102  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  33.98 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2748  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 294 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0967  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 335 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 326 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2413  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1994  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  34.2 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  36.12 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.99 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5638  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  hitchhiker  0.00205655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1439  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4884  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000596604  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 351 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 359 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 312 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0212  transcriptional regulator, LysR family  38.38 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986643  normal  0.756698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0887  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>