More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8150 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8150  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  924    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.387109  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4437  hypothetical protein  55.68 
 
 		 451 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691941  normal  0.936595 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1166  hypothetical protein  56.82 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41749  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3718  hypothetical protein  53.62 
 
 		 455 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.072939 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  53.3 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3512  hypothetical protein  52.94 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000425245  hitchhiker  0.000284968 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  52.62 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  51.25 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  51.47 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  52.15 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  51.47 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  51.47 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  51.47 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  51.25 
 
 		 446 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4297  hypothetical protein  48.2 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90094  normal  0.321538 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4978  hypothetical protein  48.2 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3182  hypothetical protein  48.2 
 
 		 448 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.224381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  48.55 
 
 		 456 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6715  hypothetical protein  46.35 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.284821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6480  hypothetical protein  47.07 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  42.45 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  41.75 
 
 		 454 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  40 
 
 		 449 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1928  aminotransferase  37.74 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2042  beta alanine--pyruvate transaminase  39.51 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2668  aminotransferase  39.39 
 
 		 457 aa  296  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5231  hypothetical protein  40.43 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157566  normal  0.634287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1320  aminotransferase  35.12 
 
 		 450 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0408042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3704  hypothetical protein  37.89 
 
 		 458 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3472  hypothetical protein  37.44 
 
 		 457 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  36.49 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2218  aminotransferase  35.67 
 
 		 450 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1296  putative aminotransferase  37.19 
 
 		 460 aa  289  6e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566567 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0281  putative aminotransferase  37.24 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5406  putative aminotransferase  37.5 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00027228 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5499  hypothetical protein  39 
 
 		 459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5308  aminotransferase, class III  36.88 
 
 		 455 aa  286  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2416  hypothetical protein  38.73 
 
 		 457 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00276802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0371  aminotransferase  41.33 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4866  putative aminotransferase  37.85 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00453658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3010  putative aminotransferase  37.13 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.115201  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2633  putative aminotransferase  36.64 
 
 		 455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0244739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5182  putative aminotransferase  35.88 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5242  putative aminotransferase  36.11 
 
 		 453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  38.77 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1902  putative aminotransferase  36.84 
 
 		 459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.483281  normal  0.25146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2828  omega amino acid--pyruvate transaminase  38.2 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375615  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2934  hypothetical protein  38.42 
 
 		 466 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.913582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3097  omega amino acid--pyruvate transaminase  38.2 
 
 		 441 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.495008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0343  putative aminotransferase  35.78 
 
 		 457 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.457259 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5089  putative aminotransferase  35.65 
 
 		 453 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441787  normal  0.847711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1738  putative aminotransferase  37.3 
 
 		 470 aa  283  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000987202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0390  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03900  putative aminotransferase  37.61 
 
 		 456 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4663  putative aminotransferase  34.73 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3172  aminotransferase  36.77 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.606908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3287  omega amino acid--pyruvate transaminase  37.09 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2727  putative aminotransferase  37.39 
 
 		 478 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1254  putative aminotransferase  39.26 
 
 		 464 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48850  putative aminotransferase  37.53 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2724  hypothetical protein  38.04 
 
 		 468 aa  279  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2317  omega amino acid--pyruvate transaminase  37.53 
 
 		 442 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414372  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0290  hypothetical protein  39.33 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0184  aminotransferase  36.32 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0145634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2379  aminotransferase class-III  35.89 
 
 		 471 aa  277  3e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00692435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1524  aminotransferase  34.08 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.642809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  38.57 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  37.74 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0199  aminotransferase  36.32 
 
 		 456 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0221401  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0191  aminotransferase  36.32 
 
 		 456 aa  276  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1727  aminotransferase  34.52 
 
 		 449 aa  275  8e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4382  hypothetical protein  37.85 
 
 		 459 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.68656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1407  putative aminotransferase  36.28 
 
 		 456 aa  275  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2709  beta alanine--pyruvate transaminase  36.92 
 
 		 443 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0655117  normal  0.245576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1519  aminotransferase  34.3 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1491  aminotransferase  34.3 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.112289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1481  aminotransferase  34.3 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1704  aminotransferase  34.08 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1636  aminotransferase  34.3 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0851  hypothetical protein  36.28 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718133  normal  0.0976867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2643  putative aminotransferase  36.32 
 
 		 460 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1778  aminotransferase  34.3 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.250209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1491  aminotransferase  34.65 
 
 		 463 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal  0.972235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3671  aminotransferase  33.85 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0477751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1787  putative aminotransferase  33.77 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1673  aminotransferase  34.08 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0301264  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3065  hypothetical protein  35.4 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0833151  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0379  aminotransferase class-III  34.46 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5668  hypothetical protein  39.76 
 
 		 457 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1366  beta alanine--pyruvate transaminase  37.16 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2631  aminotransferase class-III  37.76 
 
 		 451 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6348  hypothetical protein  36.99 
 
 		 466 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2180  putative aminotransferase  33.55 
 
 		 452 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5230  aminotransferase class-III  35.52 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>