More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7111 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7111  RhtB family transporter  100 
 
 		 215 aa  430  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  46.2 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4986  lysine exporter protein LysE/YggA  41.43 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0538724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3381  lysine exporter protein LysE/YggA  41.43 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599576  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0692  lysine exporter protein LysE/YggA  41.9 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5301  lysine exporter protein LysE/YggA  42.38 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  31.46 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  31.75 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.78 
 
 		 211 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  32.24 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5514  lysine exporter protein LysE/YggA  34.94 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.16 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5250  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1739  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0365796  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3117  lysine exporter protein LysE/YggA  34.22 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5023  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 217 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0403  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  30.84 
 
 		 218 aa  98.6  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.28 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2770  lysine exporter protein LysE/YggA  35.94 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.7 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.05 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0119  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3288  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.66 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0122  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.11 
 
 		 207 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  29.49 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  29.49 
 
 		 222 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  35.84 
 
 		 208 aa  95.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  28.83 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.81 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.44 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  30.11 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  29.55 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4452  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 		 205 aa  91.7  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3201  LysE family protein  36.81 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  32.49 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.63 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.11 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.45 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0368885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1754  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4610  lysine exporter protein LysE/YggA  31.91 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.23 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.23 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3751  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4236  lysine exporter protein LysE/YggA  28.98 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  34.48 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.77 
 
 		 207 aa  89  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3965  LysE family translocator protein  34.36 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0104  LysE family protein  34.97 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.063661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  28.96 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  32.8 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.07 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2886  LysE family protein  33.74 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3088  LysE family translocator protein  33.74 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  32.52 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3462  LysE family translocator protein  33.74 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1657  LysE family protein  33.74 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  31.15 
 
 		 213 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  31.52 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.74 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2444  lysine exporter protein LysE/YggA  27.85 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  33.7 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.76 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.69 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.52 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  32.95 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  28.11 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4795  lysine exporter protein LysE/YggA  28.29 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.23 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.424969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>