More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5346 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0355  hypothetical protein  77.26 
 
 		 389 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5346  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  796    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5853  hypothetical protein  78.04 
 
 		 390 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6766  hypothetical protein  76.74 
 
 		 390 aa  624  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2419  hypothetical protein  74.81 
 
 		 390 aa  621  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.337062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5727  hypothetical protein  51.19 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0500191  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4805  MATE efflux family protein  53.83 
 
 		 868 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3322  hypothetical protein  54.55 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0572768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3552  hypothetical protein  47.81 
 
 		 383 aa  348  7e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1550  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1501  cystathionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289622  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2491  methionine gamma-lyase  37.89 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4484  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 392 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 392 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  37.5 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 392 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  37.77 
 
 		 391 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1705  methionine gamma-lyase  36.1 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.9 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  39.49 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3326  methionine gamma-lyase  38.02 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000189507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3095  methionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 392 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416356 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  35.17 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.32 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  36.15 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1630  Cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  35.88 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0801  cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  34.91 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1242  methionine gamma-lyase  37.33 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  34.56 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  35.68 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  35.68 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  34.84 
 
 		 394 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  36.22 
 
 		 398 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.24 
 
 		 397 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  35.62 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.1 
 
 		 378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.07 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2521  methionine gamma-lyase  36 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.979889  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2643  methionine gamma-lyase  34.3 
 
 		 397 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  35.73 
 
 		 405 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1369  methionine gamma-lyase  35.66 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  32.62 
 
 		 392 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  34.3 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  35.64 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  36.12 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  33.78 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  35.41 
 
 		 392 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1559  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 392 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.950223  hitchhiker  0.000115216 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  37.29 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  35.43 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2732  methionine gamma-lyase  33.78 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0967216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3333  Cystathionine gamma-synthase  36.66 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  34.06 
 
 		 399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  33.33 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 388 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1685  Cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00806009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.78 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1645  methionine gamma-lyase  33.51 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  35.11 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1667  cystathionine gamma-synthase  38.28 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  38.17 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1611  methionine gamma-lyase  34.46 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  34.99 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  38.01 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  34.76 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  35.68 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.66 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.93 
 
 		 377 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.93 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.93 
 
 		 377 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  35.28 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  34.66 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  33.94 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  35.32 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27220  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 407 aa  210  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  33.25 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  34.4 
 
 		 388 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  35.42 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0375  methionine gamma-lyase  35.81 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1622  methionine gamma-lyase  33.24 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0317  Methionine gamma-lyase  35.79 
 
 		 386 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1507  methionine gamma-lyase  32.71 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  34.97 
 
 		 392 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  38.53 
 
 		 388 aa  209  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>