129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5259 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5259  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0135116  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4047  phage tail collar domain-containing protein  34.82 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5865  Tail Collar domain protein  37.67 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3286  phage tail Collar  35.14 
 
 		 168 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4989  tail collar domain-containing protein  35.59 
 
 		 173 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3002  phage tail Collar  37.44 
 
 		 210 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.592982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2872  microcystin dependent  37.22 
 
 		 179 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000497886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3490  tail collar domain-containing protein  31.53 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  31.08 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  31.08 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  31.08 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1668  phage tail collar domain-containing protein  31.36 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000114685  normal  0.438569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3328  UDP-N-acetylmuramate:L-alanyl-gamma-D-glutamyl- meso-diaminopimelate ligase  34.55 
 
 		 169 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  30.18 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0185  microcystin dependent protein  33.04 
 
 		 176 aa  99  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  32.9 
 
 		 198 aa  99  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  33.33 
 
 		 181 aa  99  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  35.14 
 
 		 205 aa  98.2  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1012  phage tail Collar  35.4 
 
 		 176 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0947871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0674  tail collar domain-containing protein  33.18 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.855114  hitchhiker  0.003962 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5866  Tail Collar domain protein  35.43 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255471  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2684  phage tail collar domain-containing protein  30.94 
 
 		 171 aa  96.3  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0111921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2607  Tail Collar domain protein  30.49 
 
 		 175 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2682  phage tail collar domain-containing protein  29.68 
 
 		 169 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0278651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0155  Phage tail Collar  33.04 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0184  microcystin dependent protein  31.88 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3173  tail collar domain-containing protein  29.73 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0996292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2641  phage tail collar domain-containing protein  47.42 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.262211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  31.98 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4954  tail collar domain-containing protein  32.43 
 
 		 171 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0735  Tail Collar domain protein  44 
 
 		 173 aa  88.6  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0391  Tail Collar domain protein  39.02 
 
 		 304 aa  88.2  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1350  phage tail collar domain-containing protein  30 
 
 		 177 aa  88.2  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4900  Tail Collar domain protein  32.74 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.129965  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1455  Phage tail Collar  29.39 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.349612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1349  phage tail collar domain-containing protein  33.18 
 
 		 181 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  43.48 
 
 		 163 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4253  tail collar domain-containing protein  34.58 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0588212  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0116  hypothetical protein  33.63 
 
 		 182 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.964945  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3288  phage tail Collar  31.08 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.890287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4236  phage tail collar domain-containing protein  31.65 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.290715  normal  0.365652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6119  Tail Collar domain protein  31.39 
 
 		 172 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0053  phage tail collar domain-containing protein  32.74 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2455  phage tail Collar  30.63 
 
 		 176 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0117  hypothetical protein  40.71 
 
 		 177 aa  85.5  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  0.412841 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  30.18 
 
 		 172 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1336  Tail Collar domain protein  25.91 
 
 		 169 aa  85.1  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  38.18 
 
 		 170 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2683  phage tail collar domain-containing protein  29.72 
 
 		 163 aa  84.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2009  Tail Collar domain protein  30.04 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.410779  normal  0.314034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1669  phage tail collar domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343584  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1982  Tail Collar domain protein  30.04 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4953  tail collar domain-containing protein  41.84 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5801  tail collar domain-containing protein  37.72 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1338  Tail Collar domain protein  42.27 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  28.57 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0471  Tail Collar domain protein  28.95 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2608  Tail Collar domain protein  26.92 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2609  Tail Collar domain protein  35.86 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03557  microcystin dependent protein  29.33 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1293  Tail Collar domain protein  31.53 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2328  hypothetical protein  35.81 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000740366  normal  0.751095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1337  Tail Collar domain protein  44.32 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0736  Tail Collar domain protein  40.21 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1097  tail collar domain-containing protein  30.91 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.340787  normal  0.740743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1098  tail collar domain-containing protein  29.46 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.958881  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1292  Tail Collar domain protein  34.86 
 
 		 167 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1453  Phage tail Collar  29.78 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1014  phage tail Collar  31.67 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00907435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1013  phage tail Collar  34.18 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0295632  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2329  hypothetical protein  28.83 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000218448  normal  0.931598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0737  Tail Collar domain protein  31.98 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4899  Tail Collar domain protein  28.7 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142286  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4424  hypothetical protein  27.11 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1454  Phage tail Collar  27.35 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.809591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1099  tail collar domain-containing protein  33.11 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3326  forkhead-associated  28.7 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3327  phenylacrylic acid decarboxylase  40.48 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2640  phage tail collar domain-containing protein  28.64 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.167373 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0566  Tail Collar domain protein  39.32 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0481  Tail Collar domain protein  36.61 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5803  tail collar domain-containing protein  29.6 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444578 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0167  phage tail collar domain-containing protein  30.94 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4898  Tail Collar domain protein  26.2 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.705005  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4235  phage tail collar domain-containing protein  28.12 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.296558  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03558  microcystin dependent protein  39.56 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1294  Tail Collar domain protein  39.18 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.911705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4048  phage tail collar domain-containing protein  30.8 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03559  microcystin dependent protein  28.7 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.536453  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0186  microcystin dependent protein  41.24 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2454  phage tail Collar  30.45 
 
 		 165 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.45663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2453  phage tail Collar  35.05 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0480  Tail Collar domain protein  36.89 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5802  tail collar domain-containing protein  34.72 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0118  hypothetical protein  38.38 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.595481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2343  Tail Collar domain protein  45.76 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.607801 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4722  phage tail collar domain-containing protein  45.16 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4767  phage tail collar domain-containing protein  44.44 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.428551 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4046  phage tail collar domain-containing protein  27.8 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>