210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3221 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3221  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 		 304 aa  630  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3050  coproporphyrinogen III oxidase  77.3 
 
 		 303 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2786  coproporphyrinogen III oxidase  76.32 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.893641  normal  0.534406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1549  coproporphyrinogen III oxidase  77.3 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.252724 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2169  coproporphyrinogen III oxidase  73.03 
 
 		 304 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1616  coproporphyrinogen III oxidase  71.71 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1550  coproporphyrinogen III oxidase  71.05 
 
 		 303 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1498  coproporphyrinogen III oxidase  70.72 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3246  coproporphyrinogen III oxidase  70 
 
 		 295 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.630237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2296  coproporphyrinogen III oxidase  72.11 
 
 		 295 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.803269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2954  coproporphyrinogen III oxidase  67.46 
 
 		 315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2621  coproporphyrinogen III oxidase  68.37 
 
 		 300 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2240  coproporphyrinogen III oxidase  65.36 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0647  coproporphyrinogen III oxidase  65.79 
 
 		 307 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0684  coproporphyrinogen III oxidase  65.67 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.092351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6063  coproporphyrinogen III oxidase  65.32 
 
 		 299 aa  389  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0699  coproporphyrinogen III oxidase  66.1 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0673  coproporphyrinogen III oxidase  64.47 
 
 		 307 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.496843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4671  coproporphyrinogen III oxidase  65.1 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.370983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0060  coproporphyrinogen III oxidase  63.88 
 
 		 301 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.889116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3804  coproporphyrinogen III oxidase  62.84 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6599  coproporphyrinogen III oxidase  66.67 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173551  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0734  coproporphyrinogen III oxidase  58.22 
 
 		 318 aa  342  7e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.518161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2944  coproporphyrinogen III oxidase  57.82 
 
 		 307 aa  331  8e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0279  coproporphyrinogen III oxidase  57.09 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3764  coproporphyrinogen III oxidase  53.79 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323401  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4009  coproporphyrinogen III oxidase  51.37 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.586573  hitchhiker  0.00557292 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1701  coproporphyrinogen III oxidase  52.41 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1263  coproporphyrinogen III oxidase  50.5 
 
 		 304 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2337  coproporphyrinogen III oxidase  54.13 
 
 		 291 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0674  coproporphyrinogen III oxidase  52.44 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0682  coproporphyrinogen III oxidase  53.8 
 
 		 291 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0454  coproporphyrinogen III oxidase  54.51 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0548  coproporphyrinogen III oxidase  52.15 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2536  coproporphyrinogen III oxidase  52.58 
 
 		 287 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.60563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1347  coproporphyrinogen III oxidase  52.35 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.280799  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1752  coproporphyrinogen III oxidase  50.67 
 
 		 286 aa  268  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1398  coproporphyrinogen III oxidase  53.54 
 
 		 286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.682731  normal  0.262285 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2531  coproporphyrinogen III oxidase  49.67 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0591  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 		 284 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3848  coproporphyrinogen III oxidase  49.49 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0446  coproporphyrinogen III oxidase  43.38 
 
 		 282 aa  246  3e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0752426  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1214  coproporphyrinogen III oxidase  48.74 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2369  coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 		 303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  44.11 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  43.88 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  42.27 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  42.37 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  42.57 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0674  coproporphyrinogen III oxidase  45.07 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3053  coproporphyrinogen III oxidase  42.12 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  42.71 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000149114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  43.34 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  42.24 
 
 		 304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0403  coproporphyrinogen III oxidase  43.41 
 
 		 362 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0775561  normal  0.510221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  41.92 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  45.08 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1294  coproporphyrinogen III oxidase  45.13 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.770302 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1166  coproporphyrinogen III oxidase  41.48 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.79 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0950  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  44.75 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1926  coproporphyrinogen III oxidase  42.9 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.420304  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17021  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.18622  normal  0.770424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2620  Coproporphyrinogen oxidase  40.55 
 
 		 348 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  42.19 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  42.19 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  41.53 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  42.61 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  40.13 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  0.00000553459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  41.97 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  42.09 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  44.41 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  0.0000000000135583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4996  coproporphyrinogen III oxidase  40.69 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000411147  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2294  Coproporphyrinogen oxidase  41.38 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219751  hitchhiker  0.00200729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  44.07 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  0.0000233392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1148  coproporphyrinogen III oxidase  42.3 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1178  coproporphyrinogen III oxidase  42.3 
 
 		 346 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1193  Coproporphyrinogen oxidase  41.61 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4581  coproporphyrinogen III oxidase  42.52 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  41.28 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1891  coproporphyrinogen III oxidase  40.98 
 
 		 345 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  41.2 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  43.38 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  41.47 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  41.58 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  41.58 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20281  coproporphyrinogen III oxidase  38.83 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>