More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0377 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0377  pirin protein  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4622  Pirin domain protein  87.46 
 
 		 303 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.07821 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2143  pirin like protein  72.94 
 
 		 303 aa  473  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3438  Pirin-like  70.96 
 
 		 303 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2160  Pirin-like  70.63 
 
 		 303 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.194706 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4590  Pirin-like  66 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00966452  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0684  pirin domain-containing protein  51 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00758399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1798  Pirin domain protein  52.84 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.940307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0555  Pirin domain protein  52.86 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1676  Pirin domain protein  50.34 
 
 		 290 aa  309  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.105924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2793  Pirin domain protein  51.67 
 
 		 312 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0825  pirin family protein  49.83 
 
 		 302 aa  305  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0455  pirin domain-containing protein  51.67 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.131978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1021  Pirin domain protein  51.84 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.58625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0955  Pirin domain protein  50.51 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3239  Pirin domain protein  51.17 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0101  Pirin domain protein  48.68 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3449  pirin domain-containing protein  49.34 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0645  Pirin domain protein  51.17 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0339  pirin domain-containing protein  48.18 
 
 		 289 aa  283  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1279  Pirin-like  49.49 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1669  Pirin domain protein  45.24 
 
 		 286 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2205  Pirin-like  45.24 
 
 		 286 aa  244  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0972044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0422  Pirin domain protein  45.3 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  hitchhiker  0.000103661 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1469  pirin domain-containing protein  42.81 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1742  Pirin domain protein  44.56 
 
 		 286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0541  pirin-like protein  44.37 
 
 		 298 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0436  Pirin domain protein  44.56 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3135  pirin domain-containing protein  44.56 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1118  hypothetical protein  42.19 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0129  pirin domain-containing protein  40.2 
 
 		 294 aa  235  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0459235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1112  hypothetical protein  41.53 
 
 		 285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663913  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1007  Pirin domain protein  43 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1092  pirin domain-containing protein  43.62 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1390  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.03 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000265912  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2986  Pirin domain protein  43.75 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.0758996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2497  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  42.03 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1247  pirin domain-containing protein  41.96 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.466295  hitchhiker  0.00358039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3553  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1200  putative pirin  40.2 
 
 		 283 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0487  pirin domain-containing protein  38.21 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.974974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02027  pirin  42.71 
 
 		 285 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223829  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1191  pirin domain-containing protein  40.97 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343867  normal  0.264863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01867  Pirin-like protein  40.77 
 
 		 287 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.282676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0798  Pirin-like protein  40.34 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.58528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0443  pirin domain-containing protein  41.89 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2003  Pirin-like  39.26 
 
 		 280 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4026  Pirin domain protein  41.86 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2756  Pirin domain protein  38.94 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2191  Pirin domain protein  41.67 
 
 		 292 aa  212  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1064  hypothetical protein  38.54 
 
 		 286 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.435244  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0305  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0805  Pirin-like  38.98 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3224  pirin family protein  38.21 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2828  Pirin domain protein  38.21 
 
 		 290 aa  210  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3859  hypothetical protein  39.26 
 
 		 284 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0017  Pirin domain protein  40.8 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00905247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1238  pirin domain-containing protein  39.4 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.563177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1626  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  37.92 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1885  hypothetical protein  40.55 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0013  hypothetical protein  35.79 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3297  Pirin domain protein  37.63 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0775  pirin domain-containing protein  38.89 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168068  normal  0.408223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3743  pirin  36.81 
 
 		 289 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0013  hypothetical protein  36.42 
 
 		 279 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3771  pirin domain-containing protein  34.9 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1025  Pirin domain protein  38.85 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1404  Pirin domain protein  38.39 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160916  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2950  Pirin-like protein  34.55 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2096  pirin family protein  39.74 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1509  pirin family protein  39.74 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0780  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3111  pirin domain-containing protein  34.68 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4404  Pirin domain-containing protein  37.5 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0902  pirin domain-containing protein  34.81 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0614  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1928  pirin family protein  39.74 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1949  pirin domain-containing protein  38.26 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0516  pirin domain-containing protein  39.74 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1074  pirin domain-containing protein  39.46 
 
 		 290 aa  188  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3385  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3144  putative chromosome condensation pirin- like protein  38.64 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10991 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2241  pirin domain-containing protein  39.86 
 
 		 290 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0744  pirin domain-containing protein  35.84 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0867  pirin domain-containing protein  34.11 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0892  Pirin domain protein  35.15 
 
 		 285 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3469  pirin domain-containing protein  34.11 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3276  pirin domain-containing protein  35.84 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2120  pirin domain-containing protein  38.83 
 
 		 290 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0700  pirin domain-containing protein  35.91 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0895  pirin family protein  36.27 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2227  pirin domain-containing protein  38.49 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.929804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2028  pirin family protein  37.54 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.239535  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1234  Pirin domain protein  37.21 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3217  pirin domain-containing protein  32.99 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0137  Pirin domain protein  37.79 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1464  Pirin domain protein  35.62 
 
 		 282 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5531  Pirin-like protein  38.49 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1341  pirin domain-containing protein  36.66 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2202  pirin domain-containing protein  38.16 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>