61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1413 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1413  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  811    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  53.6 
 
 
356 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0748  hypothetical protein  44.01 
 
 
377 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  42.89 
 
 
381 aa  299  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1861  hypothetical protein  32.99 
 
 
353 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  29.85 
 
 
378 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  24.87 
 
 
361 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  24.06 
 
 
341 aa  100  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3860  hypothetical protein  24.11 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.925149  normal  0.074002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0900  AAA ATPase  25.27 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0937  ATPase-like protein  21.01 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1544  ATPase-like protein  25.14 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0152832  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0488  ATPase-like protein  27.32 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0732  hypothetical protein  24.86 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.348353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0703  hypothetical protein  24.86 
 
 
399 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1569  ATPase-like protein  25.21 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.768338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1457  putative ATPase  23.48 
 
 
347 aa  69.3  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1141  ATPase-like protein  29.31 
 
 
366 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.956923  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0926  AAA ATPase  31.37 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  23.71 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  25.44 
 
 
529 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2851  SMC domain protein  56.82 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0808223 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1132  hypothetical protein  50 
 
 
358 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0249333  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  52.38 
 
 
533 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  22.47 
 
 
680 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00030  recF protein  39.58 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000612951  decreased coverage  0.0000132668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  42.55 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0470  SMC domain-containing protein  19.78 
 
 
346 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  48.89 
 
 
594 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0002  RecF protein  45.1 
 
 
369 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000642266  normal  0.645599 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  42.86 
 
 
353 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  33.33 
 
 
607 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1362  DNA replication and repair protein RecF  40.82 
 
 
339 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  36.36 
 
 
522 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2488  hypothetical protein  30.69 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.11421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  21.91 
 
 
628 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  29.13 
 
 
467 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0539  SMC domain-containing protein  40.74 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1241  hypothetical protein  46.81 
 
 
610 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.625082  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3830  hypothetical protein  40 
 
 
534 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.531313  hitchhiker  0.000259973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  33.33 
 
 
650 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4244  hypothetical protein  40 
 
 
538 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777185  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  32.48 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0582  recombination protein F  35.85 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.829059  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0499  SMC domain-containing protein  22.09 
 
 
349 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000698714 
 
 
-
 
NC_002978  WD1286  recombination protein F  41.51 
 
 
365 aa  44.3  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00030  recF protein  41.67 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.172429  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.55 
 
 
647 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0076  recombination protein F  44.23 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0004  DNA replication and repair protein RecF  36 
 
 
420 aa  43.5  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000011529  hitchhiker  0.000000444236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2610  hypothetical protein  36.96 
 
 
744 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  38.89 
 
 
608 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4388  SMC domain-containing protein  41.51 
 
 
1041 aa  43.5  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.33249 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0015  DNA replication and repair protein RecF  38.78 
 
 
340 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.486493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1869  hypothetical protein  28.33 
 
 
569 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.620953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3383  hypothetical protein  28.33 
 
 
569 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  44.44 
 
 
369 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0045  recombination protein F  43.75 
 
 
372 aa  43.1  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.498392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  45.65 
 
 
520 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  31.51 
 
 
419 aa  42.7  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>