88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3172 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  905    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  78.23 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  42.36 
 
 		 771 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  38.78 
 
 		 665 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  36.49 
 
 		 639 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  39.79 
 
 		 478 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  36.57 
 
 		 899 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  38.46 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  38.44 
 
 		 388 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  38.44 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  38.44 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  32.95 
 
 		 495 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  37.67 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  37.74 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  40.97 
 
 		 759 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  37.94 
 
 		 698 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  36.21 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  35.57 
 
 		 362 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  35.57 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  40.68 
 
 		 330 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  36.79 
 
 		 412 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  35.69 
 
 		 346 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  33.67 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  32.88 
 
 		 463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  31 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  30.9 
 
 		 811 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  27.43 
 
 		 552 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  30.82 
 
 		 587 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  27.43 
 
 		 414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  32.19 
 
 		 666 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  29.54 
 
 		 475 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  31.07 
 
 		 1132 aa  123  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  29.32 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  29.32 
 
 		 475 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  32.5 
 
 		 1160 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25.64 
 
 		 542 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  26.88 
 
 		 497 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  27.69 
 
 		 617 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  26.5 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4508  hypothetical protein  28.54 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.42849  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.11 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  29.37 
 
 		 390 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  26.63 
 
 		 586 aa  99.8  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  26.95 
 
 		 533 aa  99  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  30.42 
 
 		 968 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1519 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  26.83 
 
 		 390 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4185  hypothetical protein  26.62 
 
 		 485 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  26.19 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  26.19 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  26.19 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  28.94 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  29.07 
 
 		 926 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  28.68 
 
 		 544 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  26.09 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4286  hypothetical protein  26.21 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  24.44 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  27.69 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  27.49 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  28.28 
 
 		 487 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3999  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.79 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3978  hypothetical protein  26.09 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.461559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3184  chromosome partitioning ATPase protein-like  27.48 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0666386  normal  0.217306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.04 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.02 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.26 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.38 
 
 		 400 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.1 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  26.43 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.26 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  22.95 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  22.99 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.17 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  24.61 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  22.84 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.43 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  26.92 
 
 		 537 aa  47.4  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.89 
 
 		 288 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.7 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 		 262 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.68 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.41 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  21.43 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3854  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.53 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.460282  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.71 
 
 		 402 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  22.75 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  22.75 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  22.75 
 
 		 402 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>