More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3080 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  74.52 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  70.7 
 
 
263 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  62.84 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  57.6 
 
 
262 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  57.6 
 
 
262 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  57.79 
 
 
259 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  59.59 
 
 
262 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  57.79 
 
 
267 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  51.33 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  54.1 
 
 
294 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50.2 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.19 
 
 
278 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.49 
 
 
297 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.7 
 
 
251 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.01 
 
 
280 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
253 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 
264 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
278 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.96 
 
 
307 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 
254 aa  222  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.58 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44 
 
 
261 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  42.86 
 
 
257 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  44.4 
 
 
276 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.46 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  43.46 
 
 
267 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  43.37 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.94 
 
 
264 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42 
 
 
260 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.77 
 
 
274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  45.31 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  42.52 
 
 
291 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.98 
 
 
260 aa  215  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.6 
 
 
252 aa  215  8e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.75 
 
 
271 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.19 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.21 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  40.61 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.14 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  44.87 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.8 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.08 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.96 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.96 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42 
 
 
259 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.64 
 
 
258 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.86 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.96 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  40.96 
 
 
272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.87 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 
259 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
308 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.49 
 
 
273 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.6 
 
 
253 aa  212  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.43 
 
 
259 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  42.37 
 
 
260 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  40 
 
 
271 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.6 
 
 
306 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
264 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  42.53 
 
 
259 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
256 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  42.92 
 
 
286 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.04 
 
 
263 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  40.87 
 
 
259 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  41.83 
 
 
286 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.64 
 
 
275 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  43.08 
 
 
445 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  41.92 
 
 
289 aa  208  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  41.31 
 
 
282 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  43.08 
 
 
445 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  39.64 
 
 
271 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  39.84 
 
 
256 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
258 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  43.75 
 
 
257 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.81 
 
 
266 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.23 
 
 
254 aa  206  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  42.69 
 
 
287 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  40.23 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  38.81 
 
 
265 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  44.77 
 
 
288 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  40.23 
 
 
293 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.96 
 
 
259 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
251 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0156  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
250 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  41.73 
 
 
284 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  39.77 
 
 
287 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  43.48 
 
 
262 aa  204  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  39.84 
 
 
287 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
265 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
261 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6161  ABC transporter related  41.44 
 
 
287 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  41.94 
 
 
267 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.96 
 
 
251 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  40.46 
 
 
272 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
267 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>