More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2301 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2031  Holliday junction DNA helicase RuvB  91.16 
 
 		 361 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000121008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2301  Holliday junction DNA helicase RuvB  100 
 
 		 362 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.171399  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12880  Holliday junction DNA helicase RuvB  78.14 
 
 		 340 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.579747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3053  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.03 
 
 		 355 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.123364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1668  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.14 
 
 		 367 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.327614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6111  Holliday junction DNA helicase B  70.4 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0830946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1796  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.94 
 
 		 359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.241784  normal  0.116666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17530  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  72.29 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.200391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2354  Holliday junction DNA helicase RuvB  73.21 
 
 		 337 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2111  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.14 
 
 		 353 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00345242  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1368  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.65 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0885717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2063  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.6 
 
 		 349 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1343  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.57 
 
 		 367 aa  461  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651112  normal  0.572707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2387  Holliday junction DNA helicase RuvB  71.65 
 
 		 360 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0839  Holliday junction DNA helicase RuvB  70.79 
 
 		 382 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.153919  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15320  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.96 
 
 		 357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.280238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2093  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.71 
 
 		 351 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1994  Holliday junction DNA helicase RuvB  72.64 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1371  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.83 
 
 		 348 aa  441  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386234  normal  0.148478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1690  Holliday junction DNA helicase RuvB  68.63 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3176  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.6 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2306  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2267  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5144  Holliday junction DNA helicase RuvB  67.07 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0445122  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13960  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  71.69 
 
 		 353 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577435  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2314  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.16 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  67.91 
 
 		 374 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2302  Holliday junction DNA helicase RuvB  66.77 
 
 		 363 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3824  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.24 
 
 		 357 aa  425  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.265234 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3394  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.92 
 
 		 370 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.00000978143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2575  Holliday junction DNA helicase RuvB  62.43 
 
 		 355 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1810  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.14 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1800  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.71 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383421  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12612  Holliday junction DNA helicase RuvB  65.93 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3826  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.69 
 
 		 359 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0702287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1936  Holliday junction DNA helicase RuvB  64.56 
 
 		 364 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0836  Holliday junction DNA helicase RuvB  60.25 
 
 		 353 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0453  Holliday junction DNA helicase RuvB  61.29 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00906919  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0327  Holliday junction DNA helicase RuvB  59.38 
 
 		 355 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07050  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  56.83 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0259708  normal  0.32105 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2344  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.05 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.187034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0974  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4060  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.93 
 
 		 358 aa  363  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2211  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1116  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.78 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.848994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2944  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.75 
 
 		 335 aa  363  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000368947  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1348  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.18 
 
 		 335 aa  362  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000729469  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0820  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.02 
 
 		 358 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01601  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.56 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4657  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.81 
 
 		 354 aa  362  6e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3346  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.38 
 
 		 354 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.729811  hitchhiker  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02690  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.69 
 
 		 334 aa  362  8e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000554774  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1662  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.33 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3832  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.8 
 
 		 351 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1431  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.25 
 
 		 344 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000941483  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2557  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.9 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.829542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2533  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.13 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.26511  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0719  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.17 
 
 		 334 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.20782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3954  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.86 
 
 		 363 aa  359  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0150024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0615  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.28 
 
 		 355 aa  358  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0894  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.49 
 
 		 340 aa  358  7e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00558721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2117  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.57 
 
 		 337 aa  358  9e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1700  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.76 
 
 		 336 aa  358  9e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.979156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003922  holliday junction DNA helicase RuvB  54.6 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000262975  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1334  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.92 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00146189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3124  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 346 aa  357  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4093  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.56 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0531  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.49 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.899114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1454  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.81 
 
 		 338 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00617754  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4237  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.6 
 
 		 354 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.913769  normal  0.279005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4070  Holliday junction DNA helicase RuvB  57.28 
 
 		 354 aa  355  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1436  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.29 
 
 		 334 aa  355  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1077  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.8 
 
 		 338 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.413326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0927  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.08 
 
 		 333 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2429  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.01 
 
 		 336 aa  355  6.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00769793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1227  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.42 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1413  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.37 
 
 		 338 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000447105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0500  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.76 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3774  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.74 
 
 		 356 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1111  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.99 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0956  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00553774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1914  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.13 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.881397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0993  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.41 
 
 		 339 aa  354  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0512  Holliday junction DNA helicase RuvB  55.26 
 
 		 356 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01831  Holliday junction DNA helicase B  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.144977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1780  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2596  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0158351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1772  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0145511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0483  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.43 
 
 		 352 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2113  Holliday junction DNA helicase RuvB  58.15 
 
 		 332 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0930  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.18 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08899e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2075  Holliday junction DNA helicase RuvB  54.46 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1889  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.81 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2090  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1326  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0442858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12310  Holliday junction DNA helicase RuvB  52.62 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0273996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01819  hypothetical protein  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146272  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1953  Holliday junction DNA helicase RuvB  53.96 
 
 		 336 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.128474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0205  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0688  Holliday junction DNA helicase RuvB  56.25 
 
 		 356 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>