More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2082 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2042  excinuclease ABC, C subunit  59.77 
 
 
690 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  65.05 
 
 
703 aa  823    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  58.43 
 
 
678 aa  731    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  57.95 
 
 
647 aa  736    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  59.97 
 
 
675 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  66.06 
 
 
643 aa  860    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  62.07 
 
 
656 aa  777    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2194  excinuclease ABC, C subunit  62.44 
 
 
684 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010209  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  61.27 
 
 
660 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  59.29 
 
 
708 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  63.66 
 
 
704 aa  797    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1947  excinuclease ABC, C subunit  65.31 
 
 
670 aa  818    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122446  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  60.12 
 
 
671 aa  765    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13070  Excinuclease ABC subunit C  60.39 
 
 
651 aa  757    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  59.83 
 
 
705 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  56.73 
 
 
650 aa  729    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  47.75 
 
 
746 aa  645    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  58.47 
 
 
646 aa  731    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  59 
 
 
649 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2059  excinuclease ABC subunit C  60.6 
 
 
692 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373675  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  58.58 
 
 
679 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  61.32 
 
 
663 aa  795    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  57.33 
 
 
676 aa  728    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  65.4 
 
 
693 aa  824    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  65.41 
 
 
659 aa  820    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  58.23 
 
 
676 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  59.64 
 
 
658 aa  758    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  63.03 
 
 
649 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1997  excinuclease ABC subunit C  63.57 
 
 
644 aa  760    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.657306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2082  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
669 aa  1367    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0649427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  59.14 
 
 
675 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1110  excinuclease ABC subunit C  58.74 
 
 
641 aa  746    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.537728  normal  0.126972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  61.88 
 
 
665 aa  781    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  59.79 
 
 
666 aa  755    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  58.23 
 
 
676 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  84.89 
 
 
674 aa  1141    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  59.21 
 
 
678 aa  748    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  42.94 
 
 
780 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  38.3 
 
 
607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  39.28 
 
 
624 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0845  excinuclease ABC, C subunit  40.88 
 
 
620 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.866518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 
625 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  37.87 
 
 
685 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 
620 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 
620 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  37.3 
 
 
588 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  38.39 
 
 
613 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10610  excinuclease ABC, C subunit  36.99 
 
 
666 aa  410  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000342389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  38.61 
 
 
653 aa  412  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  37.92 
 
 
628 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
611 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  37.05 
 
 
601 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  35.7 
 
 
607 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
616 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1784  excinuclease ABC, C subunit  37.25 
 
 
737 aa  409  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 
631 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  36.35 
 
 
669 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  35.7 
 
 
607 aa  405  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  34.9 
 
 
613 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0938  excinuclease ABC, C subunit  36.55 
 
 
644 aa  405  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  39.24 
 
 
619 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  38.92 
 
 
629 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  36.57 
 
 
641 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  39.06 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  38.32 
 
 
610 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4536  excinuclease ABC, C subunit  39.12 
 
 
647 aa  400  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00719023  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 
624 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  40.47 
 
 
622 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  37.91 
 
 
627 aa  398  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  37.24 
 
 
613 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  38.31 
 
 
599 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  35.39 
 
 
607 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  36.28 
 
 
604 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  35.01 
 
 
615 aa  392  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  36.62 
 
 
617 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07090  excinuclease ABC, C subunit  37.11 
 
 
682 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.914637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  36.32 
 
 
627 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
628 aa  392  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  38.2 
 
 
614 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  36.83 
 
 
623 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09641  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 
644 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  39.3 
 
 
609 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1553  excinuclease ABC subunit C  35.13 
 
 
638 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.081195 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 
617 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  38.12 
 
 
613 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  37.68 
 
 
614 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 
617 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  35.65 
 
 
665 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
623 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0909  excinuclease ABC subunit C  35.17 
 
 
625 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  36.52 
 
 
623 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10011  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 
640 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.404154  normal  0.496638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3342  excinuclease ABC subunit C  35.55 
 
 
622 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.991937  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  35.45 
 
 
631 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  38.54 
 
 
615 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  37.12 
 
 
608 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09791  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 
652 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0046  excinuclease ABC subunit C  37.17 
 
 
629 aa  372  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.714841  hitchhiker  0.00962006 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0328  excinuclease ABC subunit C  32.76 
 
 
640 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.462253  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1945  excinuclease ABC subunit C  36.01 
 
 
643 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.892148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>