More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0500 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0500  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 388 aa  783    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  50.78 
 
 		 412 aa  362  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  38.86 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2198  oxidoreductase domain protein  39.14 
 
 		 359 aa  249  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.102162  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1908  oxidoreductase domain protein  37.02 
 
 		 347 aa  209  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  39.3 
 
 		 349 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  33.88 
 
 		 345 aa  203  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  32.43 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  32.59 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  30.25 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  33.15 
 
 		 344 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0638  oxidoreductase domain protein  35.47 
 
 		 357 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.82871  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0898  oxidoreductase domain-containing protein  35.47 
 
 		 353 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3483  oxidoreductase domain-containing protein  33.6 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4185  oxidoreductase domain protein  32.61 
 
 		 377 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3257  oxidoreductase domain protein  33.61 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1300  WblB protein  30.56 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.984195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14101  hypothetical protein  30.99 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2202  oxidoreductase domain-containing protein  37.57 
 
 		 356 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.336452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3316  oxidoreductase  30.47 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.724405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  29.76 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  29.2 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3255  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 350 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4750  oxidoreductase domain-containing protein  32.49 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331235  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0599  oxidoreductase domain-containing protein  30.48 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  31.39 
 
 		 334 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0586  oxidoreductase domain protein  32.58 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.222473  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0289  oxidoreductase domain-containing protein  34.98 
 
 		 352 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  27.09 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  30.63 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05780  predicted dehydrogenase  31.93 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1649  oxidoreductase domain protein  32.78 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.58008  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2849  oxidoreductase domain protein  32.1 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00338997  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4490  oxidoreductase-like  28.96 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4428  oxidoreductase domain protein  32.16 
 
 		 333 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 387 aa  139  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  31.61 
 
 		 355 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  32.04 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 335 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0892  oxidoreductase domain protein  32.69 
 
 		 373 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359898  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4760  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000217366  normal  0.147401 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  30.82 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0551  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 		 338 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.274192  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  23.91 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1957  oxidoreductase-like  37.67 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.476566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 344 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.55 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05530  predicted dehydrogenase  30.31 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2441  oxidoreductase domain-containing protein  30.22 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5260  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 371 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22450  predicted dehydrogenase  25.98 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0785  oxidoreductase domain protein  30.04 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  26.98 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6101  oxidoreductase domain protein  28.76 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0492878  normal  0.588599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  24.65 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6514  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4018  oxidoreductase domain protein  32.41 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  29.29 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  30.18 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2911  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2393  inositol 2-dehydrogenase  28.85 
 
 		 338 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4541  oxidoreductase domain protein  27.53 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1048  oxidoreductase domain-containing protein  24.73 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.448338  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  27.4 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3325  oxidoreductase domain-containing protein  28.81 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.941692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2621  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000494817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  32.8 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4347  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.68 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3495  oxidoreductase domain protein  25.91 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1011  oxidoreductase domain protein  27.51 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00895095  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.85 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  33.21 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  25.41 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  28.62 
 
 		 331 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1597  oxidoreductase domain protein  21.22 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5766  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.962817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  23.64 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  31.45 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.37 
 
 		 349 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  31.32 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5295  oxidoreductase domain protein  27.72 
 
 		 340 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  29.48 
 
 		 330 aa  93.6  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  28.69 
 
 		 336 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  27.35 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  30.04 
 
 		 345 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>