264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0283 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 109 aa  215  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  63.3 
 
 		 111 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  59.63 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  59.63 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  59.63 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  54.95 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  45.92 
 
 		 117 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  46.3 
 
 		 110 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  43.69 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2616  anti-sigma-factor antagonist  46.73 
 
 		 111 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  46.73 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  38.64 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.08 
 
 		 113 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.29 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  37.08 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  34.69 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  34.04 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0628  anti-sigma-factor antagonist  35.42 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  36.73 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2079  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.632413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  44.3 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  33.98 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  36.25 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  32.41 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  31.96 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.63 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1430  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0208  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  32.98 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  32.38 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  37.5 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  37.63 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  32.58 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  31.73 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  32.95 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4032  anti-anti-sigma factor  38.55 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.175492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  34.12 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  33.33 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  34.07 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  36.17 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  32.29 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4413  anti-sigma-factor antagonist  37.35 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  36.36 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  32.04 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1347  anti-sigma-factor antagonist  38.32 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1364  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  36.36 
 
 		 117 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.941434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1621  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0353  anti-sigma-factor antagonist  36.25 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1941  anti-sigma-factor antagonist  32.32 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623131  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4411  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.04 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1702  anti-anti-sigma regulatory factor  40.3 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.39095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  40.28 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  32.58 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  43.64 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1829  anti-sigma-factor antagonist  31.48 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.721407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0744  anti-sigma-factor antagonist (STAS) and sugar transfersase  41.27 
 
 		 351 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000102583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.35 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  42.19 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2642  anti-sigma-factor antagonist  35 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000138005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2424  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5095  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0932  anti-sigma-factor antagonist  30.61 
 
 		 111 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.554798  normal  0.118928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3686  anti-sigma-factor antagonist  35.79 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2518  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  34.04 
 
 		 350 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1392  anti-sigma-factor antagonist  34.88 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0962748  normal  0.699009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  33.33 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2451  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2078  anti-sigma-factor antagonist and sugar transfersase  42.19 
 
 		 332 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000182563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>