More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1562 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 183 aa  248  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 180 aa  244  4e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 182 aa  243  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 180 aa  243  9e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 181 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 182 aa  241  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 181 aa  241  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 180 aa  240  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  64.44 
 
 		 180 aa  240  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 182 aa  239  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  236  9e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  59.66 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 178 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 182 aa  231  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  55 
 
 		 180 aa  230  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  57.54 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 223 aa  229  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 184 aa  228  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 187 aa  228  4e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  53.89 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  53.89 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  53.89 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 182 aa  226  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  57.22 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  58.43 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 184 aa  223  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 188 aa  223  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 184 aa  222  2e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.18 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>